EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-17177 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:24239371-24240393 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr18:24240040-24240051TTCTTATCTCT+6.32
GATA6MA1104.1chr18:24240039-24240052TTTCTTATCTCTC-6.82
Gata1MA0035.3chr18:24240040-24240051TTCTTATCTCT+6.32
Gata4MA0482.1chr18:24240041-24240052TCTTATCTCTC+6.32
IRF1MA0050.2chr18:24239460-24239481GAAAAGAAAATGAAAGAATGA-6.65
NFAT5MA0606.1chr18:24239634-24239644ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr18:24239634-24239644ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr18:24239634-24239644ATTTTCCATT+6.02
Enhancer Sequence
CTGTAAGGGC ATCCGCTGCA TAAAACGTGC TGGATAAGTT GGCTGTTCAT TCTGCTGTGG 60
CGACGCCAGA TTAATAAAGG GACTAAGCCG AAAAGAAAAT GAAAGAATGA ATAATAATAA 120
TAATAATAAC AGTAATACTA ATTTTTGTTA TTATTATTTT TGCGCAAATA TTGAAGGCTT 180
TAAACTCATG TTTTGTTTGT GTTTGCCTGA TGCTATAGTG TCATTATGGG ACTACAATGC 240
AGCAATGGCG CTGTAAGCTG TGGATTTTCC ATTTCTCAGA CCGCTTCAGT GCGCACGACA 300
AGGGTTGCCT GATATTTAAT GTGTTTTTTA TTTGGGAAGA TGAAAGGGCT GTGGGATTTC 360
TCACACGCCT GTGGGTTGTC AGTGCTAATA GAAAAGATTG GTGAATTGGT CGCAATCCGG 420
GAGCAGAGTC GTTTTGTTAA TCCTGCTCCT CGGTGCTGTG CTGAGACTGC TTGTATTTAC 480
ATATGCAGAG GATCCCGCTG TTTCGAGAGC TCCATTCAGC AGACAGCGCA ATTAATCATC 540
CCCAAATCCT CCTGCCGTGC AACAGACGAC CCCGGCCCGA CGTGCTGCCA CAGAGAGAGA 600
GTGCAGGTGT GAATCAAGTT GCTCGAAAAA CTCCTCCCAA GTCAGTGCTT GCTTTCTTTT 660
TTTCATGATT TCTTATCTCT CCTTTTACTC GTCTTCCAAC AAAAGTTCAA TCTGCGAATG 720
ACCTCTGCTA GCATTCACCT TGAAATGTAG TCATGCTCGG CTCTGGCAGA CAGCACCGCT 780
GATGCACTTT TAGGTCTTTA TTGCATGCTA TTTTCATGCC AGCAACAGCA TTACCAAGCT 840
AGTGTACTGT ACATGGTTGC ATTATTGTTT TTTATTAATG CATGGACTAT TAAGCATATT 900
AAAAGACTTC TTACAGTAAT TCAGCACACA AGAAGTGATA AAAGTATACC AATTGAGGGG 960
TAGATATTTG TGGAAACTGA GAAATTTTGT TCCTAAGGAC TTCAGTGTAA AATAAAATAA 1020
AA 1022