EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16993 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:20230868-20232192 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD11MA0908.1chr18:20231906-20231916TTTTTACGAC-6.02
TCF7L2MA0523.1chr18:20231108-20231122GGAGTTCAAAGGAA+6.14
Enhancer Sequence
GTCCCATTGT GTTCTTCATC CTCTTTGGTT TACGACCACA AAGCAAAATA GAGAGAATCT 60
GTGGTAGCAT TTCGGGAGGG GGATTGAGGG GGGGTGATGA GAGGCGAGAG GGCCTTGTTG 120
ATCGGTGTGG AATAATAATG ACACAATACC CCATTAAAAT CTCCCTCCCA GTGACTAATC 180
CCTCTCCGCT TTAATGAGAG CCAACGAATC CAGCAGAGAC ATGGAGCGGT TCGTGCTCCG 240
GGAGTTCAAA GGAAAGGCTC TGGGAACTTT AGCGGCTCAT TGTGAAATTG ATGTAAATGC 300
CGAAGTAAGT GTCGCTAGCA ATTATCCAAA GGCATTGCTC TGGCCTAGTC TGAGTGAGAT 360
GTGATTCGGA GAGAAAAGAC GAGAGCTTGG ATAACAGAGG GCTCTTTTGC CAGTGCATGC 420
ATGGGTTTGA CGCTAACAAG AGAGCAGAGG GGGTCGCGGC ATGTTTACAA CAACACCGAA 480
ATCCCTCCGT AGGAGAGAGA GAGTGAGAGG AAAAAAATGT ATTCTCAAGT GTCATCGTCT 540
CGCTGGTTTG CGGTTAACCT AAAGCTACGT GACGCTCCGT ATTAATGGAT TGCTAATCAA 600
CAATGGCACA AGAGAGGCTT TCAGTAGCTT TTTGTAGCTA AGAATGCCTG ACAGGAGGTC 660
AGACTTCAAG GGTTTGATAT CACACAGTCT GCCAGCCTGA GCGGAATAAA TGATGGCCGT 720
TACCATTATG GAGGAGGAGA GGCTTTGTAA ATGGGAGCAT ACAAGCCTCT TGACAGATGA 780
GTCAGTCGCT GCACACAATA GTCATTAATG CGGCTGTGTT CTCAAAACGG GACTCATTGT 840
AGCATTTTAT TGTCACAGGC TGAATAGCAT TAACCCCTGC TCTGAGGATA TGAATATACT 900
CTCAACAGAT CCTCCAAATG AGGAAAAAAT GACCATCTGA CTGGTAGTGA AATATTAGCG 960
GGCCGGAGGG AGTGTGTGCG CGAGGCGTTT CTTTGGCCGT TAGGCCTCTT CTAAAGCCAG 1020
TGTAGACAGG GCTATTGATT TTTACGACAA CACAGTGAGA AGGTCATTGT GGTTGAGAGG 1080
TTTTGGGGGG ATCTTTACTG TTCATTCTGC CAGCATTTTA CCCTCAGCAG TTCCAGCAAT 1140
TTGCCGAGGC AGCTGTACCT TTCAGACAGT GGCATGTAAC AAGATCTTGG CTTCAAAACG 1200
CTGAGAAAAG AGTTGGATTA TGTTCATTAC TGAGAAACAA ACAATACAAA AATTGCTAAT 1260
AGGGGGTGTA GCTACACATG ATTCAGTCCT TGCACTAAAT ACAATCATAC AAGCTAACAG 1320
TGTT 1324