EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16970 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:20001170-20002114 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ARNT2MA1464.1chr18:20001301-20001311GTCACGTGCC+6.02
ArntlMA0603.1chr18:20001300-20001310GGTCACGTGC+6.02
IRF1MA0050.2chr18:20001968-20001989TGTTACTTTTAGTTTCTGTGT+6.22
Sox1MA0870.1chr18:20001530-20001545AGCACTGTTATTGTT-6.6
YY1MA0095.2chr18:20001341-20001353CAAGATGGCGGA+6.27
Enhancer Sequence
TTGCTGCACG TCTAGTCGCT GATGTATGAT GCCATCGTAC ACTCATTTCA AACAGTGTGA 60
AATCGCGTAA TCCGCGCGCT AATTTTTGAA CTAGAGGGAT TCCTGAACGT TTGAACAAAC 120
ACACGTACCT GGTCACGTGC CAGGGCTCCG ATCACGCTTG CGCCAGAGAA ACAAGATGGC 180
GGAGAGTGCG GAATTGAAGG TAAAGTGTTA CCCGCAAATT ACTTTCGATA CAGCCTATAT 240
ACAATACCTG TTTAGCGATG CTTTTCGTCC GGCCTGTCCC CGTGATTGAC ATTTATTCGA 300
GGCGACGCTG CGTATTAGAT TTTGGTACGC TTGATGTGTT GTTTTGAAGC CGGTTAAAGG 360
AGCACTGTTA TTGTTGTGAT GGATCCAGCT AGCTGCCAGC TAACCCGCAC AGCTGTCTGC 420
CTGCTGCTGG GAAATTAACC CTCCTCCACC TGAATTAAGA TATCAGTGCC ATTTATTCTT 480
CTTTTAACGT TTAAGGGAGT TCGTCAAATG ATTTATGGAG CGTGAGAAGA GTCAGTCGTA 540
AGTGAGAAGC AGCATGTGGG TGGTGCGTAG GCTGCTAACA GGCTGGAGAT TCGCTACTTT 600
GACAGTTTGG ACTTCTGGTA ACTTGCTACA TTTGTACATG TATATACAAA CACACAACTA 660
GTCAGTCGCT TAACCTAAAT AGTTGGCTGT AAACATTGAA TTTTTGTGGT CACGGACATG 720
TTTGAACCTT TGAATTGTGT GTTTGTGATG GTCAGAAGCT GTCTTGTGTT TACAGAACAA 780
CAACCATCGA CCACGGCCTG TTACTTTTAG TTTCTGTGTG TTTTAGTTTG AAGTTGGTGT 840
TTGTTTAGCT GGTGTTTACA TGAGGTTTTT ATTGGGAAAG GTTGTGCTGT GAGATTGTTT 900
GACCTGTACT GAGACCAGCC ACGAAAAGCT TTTAATTGTG CTTT 944