EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16965 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:19858911-19860183 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:19858928-19858940GATTGTTTTTTT+6.44
POU4F3MA0791.1chr18:19859091-19859107TTGCATTATTTATCAG+6
TP63MA0525.2chr18:19859788-19859806TACGTGTCGTGACACGTT+6.11
TP63MA0525.2chr18:19859788-19859806TACGTGTCGTGACACGTT-6.52
TP73MA0861.1chr18:19859788-19859806TACGTGTCGTGACACGTT-6.22
TP73MA0861.1chr18:19859788-19859806TACGTGTCGTGACACGTT+6
Enhancer Sequence
TACCACTTCC AGAGTATGAT TGTTTTTTTT CTGCAACAAC CACCCAGTAA AAATTTATTC 60
AACTAAGTCT CTTAACATTT AGTGGTCTAT TAGGGCTTAC GTCCCTAGGT TAATAAATTC 120
ATAAATATTG TAAAGCAGAT ATATCAGTTT TAATTGCAGT GTATAATAAT AAAAAACTAA 180
TTGCATTATT TATCAGTTAA GTAGAAAAAT TAGTATGCAA TAATATGTCT AATGAAATTT 240
TTAAAACATG CATTCGGAGG CCGACATCCT TGGAGATACA TAATATAATT ATCAGACCAC 300
AATTATCAGT GCAGTGGCTT AACATAAGTT TTGCGTTTGG CTTTAGTTAT AAGTCATGAG 360
AGTTTAAATG CTGGTTTGCC TCTCAAGGGA GCTTTCTTTC AGTATAATGC ATCCTTTAAT 420
TTCCCCCTGC CAAGCTCAGG ATGGTGTTGG ACTCCCCCTT CTATTTACCC TATTTACTGC 480
ATGTGCATTG TTTAATTATT GATTGTGCAA GAAGCCTTTT CTAAAGCAGA CGGCAGAATA 540
CCAGAACCCA TGTGGTCCTA TAGAGGAAAA GGGCACAGAG ATAAGTGTGA AAACAAACCT 600
GGAGGCAGTG TAAAGAAAGG CTGTGTGTTT GGGAGGCCCG AGGGGTGTTT TTTTAGCCTG 660
GGGCAAACCT TACAGCTATT CAGAGATGAT GGTTTAAAGA CATGCAGATC TCGCTCCATT 720
CAACGGCTGG GTGGACCCGA ACACGCTACA CTTTACACAT TACAAACATG CACGTTCTGC 780
CAGCGCACGG GTCATTAGAC ACGAGGGAGC ATTATACTAA TAGCATCAGC AGATAGACAG 840
ATTGTCTCCT ACTTATTTTA TTCAATGCAT GTGGGATTAC GTGTCGTGAC ACGTTTATTT 900
TATTGGATTT TGAACGTAAT GACACTTTCC GTATTCCTCT TTGGTTAATG TTGCATTTGC 960
GAAGTAATCC GCAAATATGT TTATATTATG TAGGCTTTAT TTTCAAAAGC CATTCAAAAT 1020
GTCAATTTAC CTGATATTAG CATTTAATGT TTGTGCAGGA TTTGCTGGTA TGTCTAATGT 1080
TGAATGTATA GACTATTTCA ATGTGGCAAT GTCATTGGCT CATGAAAATT TCCTGCATGT 1140
TGTCAAACTA TTTCATAACT GTAACAAGAG GCAGCTCAAT CATAACTTTA CAGTACATCA 1200
AAACACCTGC CATTGGACTG TTTATCAATA TGCAGCTTTT TTTGAATTCT CGAAAGCTAT 1260
GGAAATTAAA AA 1272