EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16711 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:12482809-12484013 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr18:12483862-12483875CTGATTAAATCAG-6.23
Gfi1bMA0483.1chr18:12483277-12483288AAATCACAGCT+6.14
PBX3MA1114.1chr18:12483453-12483470TTGTCTGTCACTCATTC-6.2
SOX21MA0866.1chr18:12483136-12483151AACAATACCACTGTT-6.51
Sox1MA0870.1chr18:12483136-12483151AACAATACCACTGTT+6.12
Enhancer Sequence
ACACACACCT CCCTCAAACT TTGCATGGTA TTAGAGCAGT TTTAAAGGTC TCTCGCTAAA 60
GGCTAAACTC CCGTCATCTT GCCAATAAAC ACATCCAGTT ACCGGATGCT GATCGCTGAT 120
CTCAAACGAA GCAGACCATG ACATCACTTA CCTGCAGCAG GTGAATCAGC GATCACCACG 180
GAGACGAGCA TCAGCAGCGC GCACGCGGTG ACCTGACGAC GTCCCTCCAT CATTACACCC 240
TCCATTTACT GAAACTCATG TTTCTTCCAA GGTGATCCGA GGAGATTCCA CGCGTTTCAC 300
TAGTCGCTGT GAACTGCAGC AGACGAAAAC AATACCACTG TTATATAGGT CATACTTTTC 360
AGTGCTATTT TTTCAGCATG TCTTCATGAA CACTCCTCTG ACCAGATCTA ACGATTTAAT 420
CACAAACCGA ATAAACTGCA TCTTGCACGT TAGGAAAAGT CTAAATTTAA ATCACAGCTG 480
TAGATTTTAA CCACTGAAAA GCATTGCCAT GCTGACGGAG TGACGCTCGT GCAGAGCGCG 540
GACAGCACGG TTCCTTTTGT TCCTTAACTT GTCCGAATCA TTTCAACGAC TCGGTTCTTT 600
AGAACGATTC GTTTCAAAGA CCGAGGCGCA ATTACGTCAT CGAGTTGTCT GTCACTCATT 660
CCATCGTGAC AAACATTTCT TATATAGGCA CTCACAGGTG TTCATTACAT TTTTGTGAAC 720
AAGTTTTATA AATTAAGGAT ATCTGATGTA AATTACGAGC AGTTTGTGTT GCAATAATGT 780
TTTTATGCGA GTCTGAGTCA TACAAACAAT GAGTTCGAGA GTAACGGTCG GTTAAGTTTT 840
CTTACGGGGG GAAATATGTG AGGTAAGATA AATAACAGTA AAGTGTTCAC TTTTAACAAA 900
ATACAAAATT GAATTGAATC TGATAACATA CACAAACATG TAAAAGACTG ACAGAATCCA 960
GTGGTATAAA CTACAATGTT TCTGACAAAT ACTTGCAGCT TTGAATCAAA TTAGAGATAC 1020
AAGATAAATT CACAACTTAC ATTAACATTC AATCTGATTA AATCAGTTTT TTTTCGATGT 1080
GACTTAATCT AAATTTTCTG TTTTTAACAT TTTTTCACAT TTTACCACAA GTGTCTTTCC 1140
AAATATAATT CACTTACAGG GAAAGACGAT TCTCGTTTCA ATGACTCGAA TGAATCATTT 1200
AGAA 1204