EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16558 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:5953047-5955101 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT-6.02
MSCMA0665.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr18:5953444-5953454AACAGCTGTT-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr18:5953760-5953775TGACCCTTTGACCTG-6.43
POU3F1MA0786.1chr18:5953930-5953942TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr18:5953930-5953942TCATTAGCATAA-6.44
RarbMA0857.1chr18:5953760-5953776TGACCCTTTGACCTGG-6.55
RargMA0859.1chr18:5953759-5953775CTGACCCTTTGACCTG-6.81
Tcf21MA0832.1chr18:5953442-5953456AAAACAGCTGTTAG-6.14
Tcf21MA0832.1chr18:5953442-5953456AAAACAGCTGTTAG+6.34
ZNF24MA1124.1chr18:5953269-5953282GAATGAATGAGTT-6.11
ZNF24MA1124.1chr18:5953265-5953278AAATGAATGAATG-7.34
ZNF384MA1125.1chr18:5954225-5954237AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:5954226-5954238AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:5954227-5954239AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:5954228-5954240AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:5954229-5954241AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AGTTGGCGTT TCTGTATGGA GTTTGCATGT TCTCCCTGTG TTTGTGTAGG TTTCCTCCGG 60
GTGCTCCGGT TTTCCCTCAC AAGTCCAAAG ACATGCGGTA TAGGTGAATT GGGTAAGCTA 120
AATTGGCCGT AGTGTATGTG TGAATGAGAG TGTATGGGTG TTTTCCAGTG ATGGGATGCA 180
GCTGGAAGGC AATCCGCTGT GGCATGTTCC AAGAAAATAA ATGAATGAAT GAGTTAGCAT 240
GAACAAAATT GGTTGTATAA TATTGAATTC AGCTTTATGC ATCTTAATCT CCTGTTACAC 300
TTCATTAGAC AGAATTGTAT TGGTAATCAA TACTTAAAAC ACACATCAAA TTTGGTAACA 360
TATAAAACAA AACAACTTTT GAAAACACCA TTGCAAAAAC AGCTGTTAGT AGCATTTCTT 420
TAACGTCGTA GCATGCAGCG CAAACGCAAT CCAAACATTT GCTGACTAAG ACACGCAGTT 480
TTCCCCCCTC TTTTGTGCTT TGCGCTGTCA GTTTGACACG GTCGCCGTAT AATATTTCGG 540
TCGAGCATCT GTTTCTACAG GGCAGGAACT GAGCCATCAT GTTAGTAGAG GGGGGCTTTT 600
TAAAAATCAA GCCTGTGAAA TGAGATGCTA ATCAGAGGCA GCAGGAGCAT GAACAGGCTA 660
CGCGTGGCTG CCGTGAATAT CTCGCACTGA TATGATAAAT TATGCTAAAT CTCTGACCCT 720
TTGACCTGGG GGGAGTCTGG CGTATGAAGG TTGGTTATAC GGTTTGGAGA CCCGACACCC 780
TGCGTAAAAA TAAGTGAAGA TGCTTATTTT AAGAGTGTGT ACAGGTGGGC ATGATCCGGG 840
AAAAGGTGGG CAGGATGGAA AGGAGGAGGG CTTTAGCATT TAGTCATTAG CATAAGAAAA 900
GTGCGCAGTG TAGTGGTTCG AGCTGTGCGT ACTTGATAAC GGCATGAAGC GTGCCAGACA 960
AACACACACT TAATCGTACA TGACATCACA CCAGGTGGTG GCCAACACCA CATGTCTTTC 1020
CCTCTTTCTA TTTTGCCCCC TTTTCTTTTG GTTTCTTAAA GGAGAATAAA TCCTTGACGC 1080
ACAGTTTGTC CCTCAGCAAT GCTTTGTGAC TCAGACCGTA TACAAAAGCG ATGGATTAGG 1140
GCTTATTCTG GCGTCTTTTG TTTACCATGT CATCAAAGAA AAAAAAAAAA AAAAGCACCA 1200
GGCTATGCCA TAGCAGAGCT AATATGAGGA ATATTTTGTA CAATTTTTAT ATTAGAGCCC 1260
CCTGCATACA CACTGTGTCA CTTCTTCATT ATATATGATG GATAGCCCAA TTTAAAAAGC 1320
TGCTGAGGGA GTCTAATTTA GGCATGAGAT TTTTAACGAG ATTAAACATT TCACATTCAT 1380
AGCGGGTAAT CGATGCAGAC ATTTCTATCA TACGTGGACC TGGCTGCTCC AGTGTTTACA 1440
TACAGATTTA AATATATCCG TCAGAGAGTA ATTACATTAA AGTCACAGCG GAGGACGGCC 1500
TTTCTTGGGT CTGAAGGTTT TTGCACTTTA TTTACAGAAT ATGTAAGCGC TGAACGCGAA 1560
TGTGAAGAGC AAACTGTTAC CCGTTTACTT TCATGTTCGC GTCCTCCGCT TTCCATTCAA 1620
CTGTGTTTGT CATTATATTT CAGTAATGGG AAATTTTCTA ATTTTCCCTA ATCTCTCCTC 1680
GACTCGGCGT GCAGTCGTCT CTTTTCTTTT ATGGAAAATA TTGCGGAGGT CCTCTGGTGG 1740
CCCGTTGGTT GGGGCATGAT TTATTTGAGT TATGTGTGGA TGTCCAGTGC AGAATAGGCC 1800
ATTGTGCGAA ACACAAAAGA GAAAGGCCAG TCTCTGCAGC CGGGCAGATG GCACATCCTG 1860
AAATCAGAGA CAATAGTCTT CACCCGGACT TCTATTAGAG AACGCAGAGA GCTGCATACT 1920
AATCATGCAT ACATTAAACT GGTGGCCGGT GCTGGACTTT AGATACTGTG TTTAATGCCT 1980
CAGAATCATC AAATCTCAGA TTTATCATCC ACGAGTGTTT TTTACAATTA CAGTTTAAAG 2040
AGAATTAGCA TGAG 2054