EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16516 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:5125233-5126247 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HAND2MA1492.1chr18:5125258-5125268AACACCTGCA+6.02
RREB1MA0073.1chr18:5125540-5125560ACCCACAACAACAACCACAA+6.08
RREB1MA0073.1chr18:5125474-5125494ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125603-5125623ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125774-5125794ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125837-5125857ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125900-5125920ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125966-5125986ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5126032-5126052ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5126098-5126118ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5126164-5126184ACCCACAACAACCACCACAA+6.59
RREB1MA0073.1chr18:5125666-5125686ACCCACAACAACCCCCACAA+6.81
Enhancer Sequence
CCACACTAAC TACAACACCA ACCACAACAC CTGCAACAAG TTCAACACTG ACTACAACAC 60
CTACAACAAC ACGTACAACT GCACCCACAA CGTCTACAAC ACCTGAAACA TCACCATCAA 120
CATCTACAAC AGCATATACA ACAACCCCCA CACCTGTACC AACAACAATG CCCGAACCCA 180
CAACAACTAC CACAATAGTT CCTACAACAA CACCCACACC TGCACCAACA ACAACGCCAG 240
AACCCACAAC AACCACCACA ATAGTTTCTA CAACAACACC CACACCTGCA CCAACAACAA 300
CGACAGAACC CACAACAACA ACCACAACAG ATCCTACAAC ACCCACAACT GCACCAACAA 360
CAATGACCGA ACCCACAACA ACCACCACAA TAATTCCTAC AACATCCACA CCTGCACCAA 420
CAATGACGCC AGAACCCACA ACAACCCCCA CAATAGTTAC TACAACAACA TCCACACCTG 480
CACCAACAAC AACGACCCAA CCAACAACAA CCACCACAAT AGTTCCTACA ACAACGCCCG 540
AACCCACAAC AACCACCACA ATAGTTCCTA CAACAACCCC TACACCTGCA CAAACAACAC 600
CAGAACCCAC AACAACCACC ACAATAATTC CTACAACCCC CACACCTGCA CCAACAACAA 660
CGCCCGAACC CACAACAACC ACCACAATAG TTCCTACAAC AACACCCACA CCTGCACCAA 720
CAACAACACC AGAACCCACA ACAACCACCA CAATAGTTCC TACAACAACA CCCACACCTG 780
AACCAACAAC AAGACCAGAA CCCACAACAA CCACCACAAT AGTTCCTACA ACAACACCCA 840
CACCTGAACC AACAACAACG CCCGAACCCA CAACAACCAC CACAATAGTT CCTACAACAA 900
CACCCACACC TGCACCAACA ACAACACAAG AACCCACAAC AACCACCACA ATAGTTCCTA 960
CAACAACACC CACACCTGAA CCAACAACAA CGCCCGAACC CACAACAACC ACCA 1014