EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-16408 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr18:740609-741576 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr18:740903-740914AACCACTCAAG+6.32
POU4F1MA0790.1chr18:741306-741320AATTAATAATGCAG-6.35
POU4F2MA0683.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.67
POU4F3MA0791.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.75
PRDM1MA0508.2chr18:741338-741348TCACTTTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr18:740974-740994CCCCAACACACACACACACA+7.29
Enhancer Sequence
TGATTAGTAA AGCAAATGCA AATGTGTGTT TATTTGAGCA GCGAGTATCA CAGTGTGCGT 60
GTGTGTCTGG AAAAACCCCG TCTGTAATCC AGTGCAAATA GTTGCCTTCA GTCCCACCTG 120
CGGACCCACC CGGAGTCACC AGACAGAGCG GAAAACACAT GGGATTATCC AGTAACACAC 180
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACGTAC TGACTATGGC 240
ACTACTGAAT GTGTGTGACC TGAGGAAGTG TTCAGAAACA TCTAAACACC CACCAACCAC 300
TCAAGTTGAT CCAGAAGCAG TTCAGTAGAT TCCCTTAAAC AGCAGAGAGC ATTCCACTGA 360
CCCTCCCCCA ACACACACAC ACACACACAG TCTTACAGAC ATGCAGACAC ACAGAGATAG 420
ACATGCATGC ACACAGACGC TCATAGACAC ATAGACATAC CCATACATTC ACAGATGCAC 480
ACACACACAC ACTCAAAGAC ACGCATATAC ACACATTTGT CACAGAGACA TGTACTTGCT 540
CACACACAGA CGCATTGCAA ACTCACACAC AGACAAGTAA GCATGTATTG CACACATACA 600
CATGCACACA TAGGCAAGCA CACACACACA CACACACACA CACACACGTC TCATCCTTAA 660
TCCTCATGCT ACAGAATTTC ATTAGTTTTG AGCATTTAAT TAATAATGCA GCATTATTAA 720
TAACCCTCAT CACTTTCACT TGCAACACCA CGGTCAAGGG TTCGATTTCC AAGGAATGCA 780
TGAAAGTGTG ATGAGATAAG ATCCTCCACA CACACACGCA CAAATGCACA TGTCATATTC 840
ATGTCATATT GTTCAGCCTT TTCACTTGTA CTCGTGCAAA ACGCAAACAA GATGTGGTTT 900
AGTGAGGGAC GCAACAGCAG GAACGCTCCG GATCATTTGA AGAGTCTCTC AGTCAAACTG 960
CAGTAAA 967