EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-15416 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr17:29012677-29013831 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr17:29013735-29013745ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr17:29013735-29013745ACTAATTAGC+6.02
LHX6MA0658.1chr17:29013735-29013745ACTAATTAGC+6.02
RFX1MA0509.2chr17:29012707-29012723TGTTGCTATAACAACA+6.05
RFX1MA0509.2chr17:29012707-29012723TGTTGCTATAACAACA-6.05
RFX2MA0600.2chr17:29012707-29012723TGTTGCTATAACAACA+6.11
RFX2MA0600.2chr17:29012707-29012723TGTTGCTATAACAACA-6
RFX3MA0798.1chr17:29013491-29013507CGTTACCATGGAAATA-6.11
RFX4MA0799.1chr17:29013491-29013507CGTTACCATGGAAATA-6.13
SOX15MA1152.1chr17:29012848-29012858AAAACAATAG-6.02
Enhancer Sequence
TGCTTCCGAG CACGTTTGAG CTGCCAGACC TGTTGCTATA ACAACAACTC TCGGATGAGT 60
TTTGAAGAAT GAAATGATCC TGGATCATGT CAAATCATCA ATAACCAAAT CCAGCTAATT 120
GATTAATCCA TCAGAATCGA CATGAGATTA GATTTCTCAG ACGATTCCCA AAAAACAATA 180
GATCATTAGC TTTGAAAACG TTACAGAGGA TATCTGATGA TGTCACACAA ACTTGGCAGA 240
TTTTTTGGGG GGATTAAAAT TCACAAAGCA TAACTTTTCC TAATGACTGT TTAGTAGAAC 300
TAAAGTTAAA TGCAATATAG AGGTGTTTTA CATACTAATT CTTTACCTTT TTAAGACCTC 360
AATACATTGT CTATAGCCTT GTGTATTTAT TATGGCATTA CGATGAGTAC ATTAGCAGCA 420
CATTTCTTTC TTTTGCTTTT TATTCCTTTA ATAGAAAGAT GACATAAAGA TGAAAAACAG 480
GTTGTCTCCT CACTTGAGAA AGCAGTCTGT AATGCCCTAA GCTGCCCCAT AGCACAGGCC 540
TCCTCAGGAG GGAAACAATG CAGCTCATTA GGATGGGCAG GGCTTCTCAG AAGCACACAA 600
TGCTTACAAC CTCCACAAGC AGGAAACAAC TTTGAGCCCA GTCCCAGGAG GTCAGTAGCA 660
AAAGTGGCAA AATCATTTAA ATCTCCTTAA TGAACTGTTA ATAGGTCAGG TGTCTGTTTG 720
TGCCTAGTCT GAGCCTCTGC CTCCCCCTTG AGTTCCTCAG TCAGTCTGCC AGTCAGGAAG 780
TGGGGGAACC AGGTCAAGAG GTTGCACTTA AACCCGTTAC CATGGAAATA AATGCTTGTT 840
TATTCATGTA GCTGAGTAAA CGACAGTATC ACACATGGTT TTATCTCTTA TGCAACAAAT 900
GTGAACTGAT AGCTTTAAGC ATCTTATGAA TCTAAGTGAA ATCCAGCGCA TGATTTGTGT 960
CCATATGTTT GGCACTACCG AGCCGTTCAT GCCGTATATG TCGCAGATCG TGACTGTGTT 1020
TAGTAATTTG CTTGTTGTGG TCATACTTTA CTTTTCTTAC TAATTAGCAG GTCAAATTCT 1080
CAGTGGCAAA GTGAAATAGC ACTTTGAATC GGTTAGTGTT GTGCATTGCA AGGCCAGCCC 1140
AATCAGAGGC CACT 1154