EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-15401 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr17:28746241-28747295 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr17:28746758-28746773CAATAAATAAACAAC+6.07
Hmx3MA0898.1chr17:28746359-28746376TCAATCAATTAAAGAAG+6
Nkx3-2MA0122.3chr17:28747232-28747245TTAACCACTTAAA+7.12
Enhancer Sequence
AATGAGTGCA TTACAATAAA ATAGAGCTAT CTTAAAAAAA AACTTCAAAC ATTAGCTATC 60
CAGAAATCCC TAAAATATCT TTCAAATCCC TGATTCTTTT TTCCCATTTG ATCCTGAGTC 120
AATCAATTAA AGAAGCTTAA CATGTTTTTT CCTCTCAGAT ATATAGATAT ATTGTCTAAA 180
AAAAATCAGC GCCAGTATTT GATTGTCTTT TGTAAGGCGT GAGATATCAC AAATACTTTG 240
ATGTCTTTGA CAATTCAAAA CATGAGCTGA AAACAGAGAC AATTAACTCC ACAACCCAGC 300
AGGTGGGAAT ACGGGAATAG CCAGCTCCCC CTACATCTGC ATTTGAATCC CCTGAATCTC 360
GACTTCAACC ACCCCAACTC ACACATATGG TCATTTCAAA GTCTGAATGT TCTAAATTAA 420
CCCAAGTGAC TTTATCTATC ATGTTTAATT TCATTTGAAA TGTCTCAGTG CGACTGGTAC 480
AATGGTCTCA TTCTCTCAGT AATAGACATA ATCAAAACAA TAAATAAACA ACTTTAGGCA 540
TCTTTTGAAC CACTGTAAAG GGTGTGACTT TCACACAGGC AGTACTAAAT GAAAATGCCT 600
TTTGTTATTT ACACAACCCT TTCCTTGAGG GGATTCTTGG ATTACTTAAG GGAACATTTG 660
AAAAATGTTC GGGGTGAATC TGCTTACCCA GATCAGCCCG TAACATGGAG CTTACGGTAT 720
TTCCTCTAAT ATTTTTTTCT TTTGGAGAAA GGCTTATTTG TTTTATTTCA GCTGGAATAA 780
AAGCAGGTTT ACATTTTTTG AAACCTATTT TACGGTCAAT ATTATTAGCC TCCTTAAGCA 840
ATATATTTTT GATTGCCTGC AGAAGAAACC ACTGTTATAC AATGAACTGC CTAATTACCC 900
TAATTAAGCC TTTGAATTGC ACTTTGAATG CTTATATTTT GAAAAAAATA TCTAGTAAAA 960
TATTTTGTAC TGTCATCAGA GCAAAATTAA ATTAACCACT TAAACTCTGC TGCTATTTTG 1020
GGATTTCCGC CTGGATTTTG CCTACCCAAA TTTA 1054