EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-14256 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:53035689-53036845 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX3MA1114.1chr16:53036194-53036211TTCTGAGTGACAGTCCT+6.08
PHOX2AMA0713.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
POU2F2MA0507.1chr16:53036770-53036783AAATGCAAATGAG-6.28
POU3F3MA0788.1chr16:53035950-53035963ATATTAGCATAAT-6.46
PROP1MA0715.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:53035959-53035970TAATTAAATTA-6.62
RORA(var.2)MA0072.1chr16:53036397-53036411AATAATTAGGTCAC+6.16
RORBMA1150.1chr16:53036400-53036411AATTAGGTCAC+6.62
RORCMA1151.1chr16:53036398-53036410ATAATTAGGTCA+6.74
Enhancer Sequence
CCAAGTAATT CAGACAAACC AGAATGCAAA TCTCCAACAC ATGAGTGGCT GAACTTGTCT 60
TACTCACAGA CTGAACTCCT GCTGTGCTTT TCCTGCTAAA CATGAACAGA ATGATTGTTG 120
CCTAGCAAAT GTAATCATAA ATGAAGAACT CTTCAGATTC AGAGAACTGG AACATCGATT 180
AATGAGCAAC TTCCACTAAA CCACTTCATC CAGGAAACTC TTCTGCTATC AATAACAACG 240
CTGACTAGCA TTTATAGTAT TATATTAGCA TAATTAAATT AGCGTTTCAC ACTCTTTCGA 300
ACTTTCCTAC AGCATTAATA CGACGAATAT GAATATCTAA AACAACTAGT AATGGGATTT 360
TTGACTAATT AAATACATTA AAGCGTGTAA ATAATAATAA AAATCACTTA CATTCGTCAT 420
TGAACGGTTT CCAGCAGTGT TTTGTGGACC GACATCTGCT GTGTATCATC TGGATCTCCT 480
AGAGACAGTT CGCTGATCCA TTGATTTCTG AGTGACAGTC CTATTAAAAG GCGCTATTCA 540
GTCAGAAATG TGCTCATTTC GTATATTCAG TCCCATATAT GATGTGAAAT CGTTATATTG 600
TTTAATATTC GTCAAGATAT TGGCTAAAAT ATCTTCTTAT GCGTGCGCGC TGTACGCATT 660
TGACTTCAGC CGGAGAAAAT ATGAACGGTG TAAACACAAC TGTTGAATAA TAATTAGGTC 720
ACGCTCTGCT GCCGTCCAAT AGCGCGCGGC AGCTCATGAA TATTAAGTAA GTCACGCTGA 780
CGTTGGCTAA TAAAGTTAAA GCAGCTCATG AATATGCAGT TTCAGAATTT TGCGACTCGA 840
AGCGTTTAAG AAGAATACAC AAAAATGTAA TCAAATGTAT TTTTTTAGAA TTAATTTGAC 900
GTTTAAAACA AACAGAATCA ATTAGTATAA AAGTGGCATT AATATCCCTG TAAAGTCTAA 960
CTTTGACTGT AATTTGATAG GGAAATGTTC AAACAATGTG AAAATGAGCT ACTAGAGAAC 1020
ATGGAAGTTC TCTGTGGAGG ATTGTAACTG TTACCTGGTT ACCACTAGAA CATGCAAAGC 1080
TAAATGCAAA TGAGATCTCT ATGAATGAAG TATAAAGACA CGAGTTTTAC GCTGCAGACA 1140
ACTATGCAGA ACAACT 1156