EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13838 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:40188846-40189438 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr16:40188982-40188999ACAAATTAATTAATTCA-6.36
Lhx3MA0135.1chr16:40189000-40189013AAATAATTAATTC-6.22
Lhx3MA0135.1chr16:40188985-40188998AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr16:40188984-40188997AAATTAATTAATT+6.92
POU4F1MA0790.1chr16:40188998-40189012ATAAATAATTAATT+6.63
POU4F3MA0791.1chr16:40188995-40189011TTCATAAATAATTAAT-6.12
POU4F3MA0791.1chr16:40188998-40189014ATAAATAATTAATTCA+6.28
POU6F1MA0628.1chr16:40188986-40188996ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:40188986-40188996ATTAATTAAT-6.02
SIX2MA1119.1chr16:40189067-40189083TTCTGAAATCTGATCC+6.79
SOX10MA0442.2chr16:40188970-40188981AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
TTGACGTCAT TATAAATACA CAGATCACTC TGCCTATTCA TGTCCACTCC AGCGGAAAAA 60
AGTGATTGCC AGGTGGTGAT TTGTGTTTAA CTTATCTTTA TTTATTTATG ATTTGGTTAT 120
GGGTAAAACA AAGAAAACAA ATTAATTAAT TCATAAATAA TTAATTCACC GCCGCTCAAG 180
GCTTAGTTTG TGCCGGAACA TGCCGGATCC AGATCTGGCA CTTCTGAAAT CTGATCCGGC 240
ACCTCATCTT ACCAATCCCC CTCCTTAACC GCCCTTCTCC CCTATCCGCT GTTCACTGTC 300
ACTTTCCTCT GCGACTCCCC AACTCTTCAC TTTTGTCTGC AACACCCCCG CCCCGCTCAC 360
TATCGTTATT GACACCCTTG CGCAATCCAT CACACCAGTC TCCTTAACCC CGATCTGTTC 420
CAGGATTGTT GTCGATCCCA GTTGTAAGAG CTACAAATAA TAACATGACT TCTAGTTAAT 480
CATTTGGAAA AGTGGCAGAA GGTAGATTTT TCTGATTAAT CATCTGTTGA ACTGCATTCC 540
GATCATTAGA AATATGGCAG AAGACCTATT TAAACCCACA TGGACCCAAG AT 592