EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:36424101-36426151 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:36425812-36425825ATTAAGTGTTTTT-6.42
PBX1MA0070.1chr16:36424549-36424561ACATCAATCAAA+6.74
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.52
RFX1MA0509.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.54
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.39
RFX2MA0600.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.16
RFX3MA0798.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.26
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG+6.18
RFX4MA0799.1chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.51
RFX5MA0510.2chr16:36425220-36425236AGTTGTCATGGAAACG-6.01
RUNX3MA0684.1chr16:36425324-36425334AAACCGCAAA+6.02
Enhancer Sequence
ATTAAACATG AGTGAGCAAT CAAACATGAT TTCTCTAAAG TTGATGTCCT CTAAACTGGA 60
CTAGGGTGAA CAGACTTACC TGTTTGCCGT CCATTTTTCT GATACCACGA TAGACATTGC 120
CGTAGCAGCC AGCTCCAATA TTTTCTTTCA GGTCATATTT TGCTTCCACT GAAAGATAAA 180
AACAGCATGT TCATTTGAGA CAGCTTCTAG TTATGCCTGA ACAGACAGTA TAAAAATAAA 240
GCCATTTAAC CCGTAACAGC CAACAACATA AACAAAGCCA ATTTGCCCCG AATTAAGTTT 300
TTTGAAACTT TTTTTAATTC AAAAGCCTTT TCCCAAAATA TGTCAAAATA GTTTGTCACT 360
AAAAAAATCA CTCCATTTGC TGAAACTGAG AGAAAGTTGA GGCCAAATGA CCCCAGTGTG 420
TATGAAACAG CAACACAAGG GTTAAACAAC ATCAATCAAA CATTAAAAAT ACATTCAAAT 480
GTACCAGAAC CAGGAGAAGG CCCTATCCTC TGTCTACATG GCGGTCTTCT TTGTCCGGAA 540
GGACCGGGAA CATGTAACAT ACTTTTTTCC ATTTATTAGC AGTAAATAAC GCTCTCTAGG 600
GTGTATAAAT GAGTTTACTG CAGTTAATTA TCTGAGTTTT CGCCTTGTCT GAGTATCAAA 660
TGAAAAGTTC CTCAATACAC GTCTGTTCTG TCAGGCGTCT GGTGGATTCT GACACTCGCG 720
GTGCAGAGCG CGTTCGATTT ATGACGTAGC GTAGGGCCAG ACCAAAGATG GGATGGGGGT 780
CCTGTAGGTA CAGGTGTTCG CGTTTATTCT TCAGGGTGTA AAAGGTGAAG TGGCATATTA 840
ACCTACTGTT TAGGGCTCGT GATAACATTA TAAAATACGC GTGGACCTTA TACAACTCTT 900
TTGCCATCTC TGCATGGGGA AAAGAGGGAA GAATAAAGTT AATCACGCAA GGCCTGGCAT 960
GATTGATGTT TGACGGGTCC AACACGGCTG ATTAATTTGA GGACTCTGCA TCGGCCTTTA 1020
GCTCTGCACT GAATTTACAA TGTAATACGG AATCACGATG CGTTGACTCT TGTCCAGAAG 1080
TCTGCTGCTA AGAAATCGAG AGCTCCGGAG TCTAATGTTA GTTGTCATGG AAACGAGGAT 1140
GTCTTGGCGG CAGTACGTGA AGTTGCTAAC CTATGGAATA AAATTTCTGT TATAATTATA 1200
AAATTCACGC ATCTGCAATT ATGAAACCGC AAAGGAAAAC GGAACATAAC TTGTGACGTT 1260
ACTTTACAGA CACGAAATAG TTTCACCACG GACACGAAGA GTACGAATCA AACAGCGACA 1320
GTCCACTGTC AAAATACATC ACCGCGGTCA CAGGCATTAA TAAACGAGCC AGAGTCATCG 1380
ATCACAACAG TGCGCTTGCG TGATGAGATC CTGAATCCTG ACTGAAGGAA GCCCCCCGAA 1440
CAAAATGTCT GGGCAGCTCC CACACACCGT CTCAGGTAAG ACTTTTGTTA ATCCCTCTTT 1500
GAGAACTGTC CTCCATGAGC TGTAATAAAG GTTGAGACTC AATGAGGTCC ATTTTCGCTG 1560
TGTTTCTTAG ACATTTTACA GAATCAAAAT TAAGATCGGG CCGAGGATAG CAAGCTAAGT 1620
TAGCATAACG TAAGTGAACT TGACAGGCAG CGAGCGCAGA ACTTCTCAGT GAATCACTTA 1680
ACGGTGTTTA ACTATAACAT GGCATCTGTT GATTAAGTGT TTTTGAAAGC CAGATAGACT 1740
ATTGATCTAT TATAAAGAAG ATATCAGCAA AAGGCAAGTT AAATATTTGA GGGTTTTTGC 1800
TTATTTTTAT GACACTGAAT CAAATCCATC AATTGTTTAA AAAACTTGAG ATCTACGTTA 1860
ATTTATCTTA TTATCACCGA ATGAGTGGGA AAATATATTG AATAATGTAA TAAAGTCTGT 1920
GCAGATTAGC AATTGGTTAA ATAAGTGACC CGGACCCATG GGCGTAAATC ATGAGGGGCA 1980
GTCATTTAAA CACTCGTATT TCATCTGAAA GCTGAATAAA TAAGCTCCTC ATTGATTTAT 2040
GAGAGAAGAT 2050