EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13424 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:29275866-29277598 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr16:29277198-29277209GTTTTATGGCA-6.14
CLOCKMA0819.1chr16:29275965-29275975AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr16:29275965-29275975AACACGTGTT-6.02
SOX21MA0866.1chr16:29276104-29276119CACAATAGCATTGTT-6.51
Sox1MA0870.1chr16:29276104-29276119CACAATAGCATTGTT+7.91
Enhancer Sequence
CCTTGTCATG AGTTTTACTG CTCATAATCG CCTTGAGAGC ATTAGCACAC TTTCGTGGCC 60
GAAAATCGTG GTGCTGATTT GGTCAAACTC CTCGTTAGAA ACACGTGTTC TTATTAGGAA 120
TAAATCTCAA CAGCCTGACT TCTGGAGCGC GCGCTGGAAG TCTATGAAAA TCATACAAGC 180
CACTGCGCCC TGGCAGAGTC TCATGCGCAC ACGTGGGCGC TTAATGCATC AAACACATCA 240
CAATAGCATT GTTTAATATG ATTATACTTT TATTTTAAAC CTTATTAAAC GTATTAAATA 300
GGCTATATGT TTATGCTGGC TGTAGGCTAC TGTTTATGCT TTAAAATTAA ACGTGGAGCT 360
TTGAAACTTT CGCGCATGAG TGCTTATATC CACAACTTTC TTAGGCCCAA AGTCTAAAAG 420
TGAAAAACAT AAAACACAAC GCGCTTGTTT ATTTCTAATT GATCAGGCCG GTGATTAAAC 480
GTGTTGGGGA ATCCCTCGGG AAATGAATGA AATGTGTTAA AGCAATGGAC TAGTAGAAAC 540
ATGTTGTCGG TTGATAATTG ATAATAACCC TGGGACGTGC CATCACTGAG CAGAGTCTGT 600
CTGATTCTCA CAGCATCCCT GGCGGACAAG AAGCTTTGGC GTATTATCTC TAACTCATTA 660
CTCCTCGACG GGTTGGCTTT CACGAAGGGT TCGAGGCCTG GGTGCCCCAG GTGCCCTGGT 720
AACAGCGGCT TTCGCGTGCT ACCAAGATCT GGAGAAAAGA CAGCAAACGA TGGAAATCGG 780
TGGAATTTGA GACAGAGAAT GCATAAAGAG CCTGGGCTTT TAGAAAAAAG GGACTGATGG 840
AAAAACCAAG ACCAGCGGCC TCTGACAGAG TTGTCTATTT GGCAGTCGCG CCTCCTATTG 900
AACCGGTAAT TTATTCAAAG GAGATTTTTA TCCCCAGCGA TCTGATTCTT ATGATAATCA 960
ACCTACCGAG ACCTCTTTCT GTCCCCTTGT CTGGGGTCTA CTCTCGGTCC TGACGGTTAA 1020
AGCTGATTTG CACGGTTTCA CCCTGCCGAT TCAGTGGTCA CATTCCTAGA CACTTACGGA 1080
AAAAAGGCAA AGACAAAGGG TTGCTGGGAG CAAGTGCACT TGATTTAGAC TGTGGGTTAC 1140
TGTTAAAGGA GTCTCGAAGT CAAAGTGTTC TTGGTTCTCC TACAAAGGGC ACTTATTCAC 1200
TACTGCATCA CAACAATCGA GGCCTTACGG ATGATGCAGA TATAGAATGA TGCTTATGGA 1260
ATGAATCTTT ACGCAGCAAA TGGTCAGACT AAATTGCACC AAGCCGCATT AATTGATTTG 1320
TGCCAACAAA ATGTTTTATG GCATTAATGG TTCCACGAAG AACCTTTAAC ATGGACTTCA 1380
AAATCAAGAT TCTTTGTTGG CATTGAGGAT TGATGAAAAC CCGTGAAACA AAAATCCCCG 1440
ATCTCTCGTA GGTTATAGTG AAGAGGATTA TTTAGGTTAT TAAACTGTTG TTCACATTAT 1500
CAATCACATG ACTCTACAAA GACCATAGAA ATAAATGCTC TTTTGGATGT TATAAGGCAT 1560
CACTGGGGAA AATGGAATCA CTATTTCGAG TGAAAACTTT CCAATCTACA AAACATTACT 1620
GATGATGAAA AAAAGGTTCT CACGGTTATT AAAGTCTTTT TCCAACTAAG AAAATTGGCC 1680
TTTTTAAGAA AGGTTTTTTG GAAGCCCAAA ATGGCATTAC CCATTTGGAA CC 1732