EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13259 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:25071697-25073059 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX3MA1114.1chr16:25072015-25072032CCCAGAGTGACAGGCAG+6.13
Sox3MA0514.1chr16:25072888-25072898AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr16:25072879-25072891AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr16:25072880-25072892AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
ACCCTTTAAG CCTCATTTAC ACTAAGAGCG ACTCGCAGCG GTAAAGCGAC AAGCAACCGT 60
TCATTTTAAC GGAGAGCGGG CTACTTTCGG CAACCTTCGT CTATGCGAAT GAGTGATCGT 120
TGGCGACCAG GTGGGCATGT CGAGCAACGC AACAAAGTTG AAAATCCTTC AACTTTTTGC 180
AAATGAAAAG TGACTTTCTT GTGCGACAGC CAAAAGGAGC ACCAGTAGAA CTCATAGGAT 240
CCTCTCTCTG CTTGCTCAGA GGCCGGTTGT ATTCTCTGTG CTGTAGACCT ACACAGACCT 300
GTTTGCAGCT GGTGGCCACC CAGAGTGACA GGCAGCTAAG TCGCTGCTAG TGTGAATGAG 360
GCATTAAACT AGTTTGACTC GAGTTGCTTT ATCTTTTCAA ACTGATCTGA CTTTCGATTT 420
TCCAGAAAAT GACCCGAAAA TCTTGGAAAA ATCACATTAA CTTAACATTG GACCAAACTT 480
TGACGGATCA TAACTTCAAA AGAGAAATTT TTAAAAACGT GATCTTTCAC AATAAAAGAA 540
GCTGCCAAGC TGATTAAATC TACATGTAAG TTGCACCCCT GGGCAAGAGT GCCCCAAATT 600
TGCTCTTTGA CTTACAATGT GGAAGAAACT TACATTTAAG ACATAGAGAC TTCAACTCAT 660
AACATTGGAA CAAACTCCCT CTTACTGGCT CCTTACCCTA ACAACTTTTC ACTTTCTCTA 720
CCACCTCCTC TTCCCTTCAT CAGCTCTTCT ACACCACCAC CCCCCACTAG CTCTTTGCCT 780
TCAAAACAAC AACCCACCCC CCCAATCAGA AGTGCAGTAT TGGAGGCACT GTGCCTTTTG 840
ATGCCGATCA CTTCCTGCCA GCTGCCTTTG AGTCCTAGTG CAGTCAAGTT GGCTTTCTCA 900
AGCCAACATC AAGTTCATCG ATAAACTTTA GGTTCTAGTT AAACCTTAAC ACTCTGCTCT 960
TGTGGAATGT GTAATCAACG AAGATAGGCC ACCAGGCTGG TCAAATTTAG CCATGAAACC 1020
CCTGACATTT AAATTGGTCT TTTGTTTCCC CACAGCAACA ACCAGAGAAC TGCAGGCCTC 1080
ACTTGCCTCA GTTAAGAAGT TTTCATGACT CCACCATAAG TAAAAGACTG GGCAAAAATG 1140
GTTTACATGG AAGAGTTTCA TAACTAAAAA CCTCTGCTGA GCAAAAAAAA AAAAACAAAG 1200
GCTTGTCTCA GTTTTGCCAG AAAACATCTC GATGTCCCCC CAACACTTTT GGGAAAATAT 1260
TCAAAGTTTA ACTTTTTGAA AGGTGTGTGT CCCATTATGT GTGGTGTAAA AGTAACACCG 1320
TATTTCAGAA AAGAACATCA TACCAACAGT AAAATGTGGT CC 1362