EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13209 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:24043385-24044545 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr16:24044065-24044077AATTGTTTGTTT+6.22
RORA(var.2)MA0072.1chr16:24044507-24044521TTGACCTATTTATA-6.06
RORCMA1151.1chr16:24044508-24044520TGACCTATTTAT-6.44
Enhancer Sequence
ATACTGGGCC ACATGTTTGT TTTCAGCAGC TGCAGGGGTG AATCAGTCAG AGCTGAGCCA 60
CGAGAAAGCG ACAAGTTGGG ACAAGAGGCT AAAGATCACT GAATAGGTGG AATCAAATTG 120
TGGGTGATAA GGATTTTCTT ATGCTGTCAC GGAAAAAAAC ATATAATTAC TCAAAGCTTT 180
CTAGCCAGAA AAATAAAGGA TTTATTTGAC AAAAGAACAT AATCTTGTTG GGATGTGTTT 240
GCATTTTCAA AATAGAACTG CTGGAGGAAA TATAATCAGT GTAAGGAATA AAAAAGCATG 300
TCTTATCTTC AAAAGATAAA CACGTGGAGG GGCACTTTGA TCAAACAGCT GCAATCAGCA 360
ATTGTTTAAC ATGACTTTAC CTTATGTTAC ATCATAACTC ACCTTTACTA AAGCAAAACA 420
TCAAGTTACT AAAATCAGTT TAGCTTTTAA CTATAGGTTA TAAAGACTAT TCTGTTGTTA 480
CAAGCATCAT TGTTTATGTG AATGCTAATC TGAATATGTA AAGTGAGCAA ATGTATGGCC 540
AACGGGTCTA TAAAAATGCT AATAGGGTCA TTCATGTTGA TAGGCCATTC AACTGTTGGT 600
GTCTGCATGA ACGTTTGTGT CACATTCAGC CTCCACTGTG CCTTTAATCA CAAGCGATTT 660
AATCAACAAA AAATCTTTTC AATTGTTTGT TTGAAAAGAA CAGATTTGGT TTTTATCCAA 720
GCAACAATTA TTGCCTCTAA ATGTTTAACA TAATCCTATG CTGTAAGTTG TTTGATGAGC 780
TATATTTGAA TTAAATAAAT GCTAAGCAAG AAGCATTAAA TAAAAGTAAG CATAAATAGT 840
TTGTGTTGTA TATGTTAATT TTTTTATAAA AAATTCTACT CATCAAGGCT AGATTTATTT 900
GATCGTGAAT ATAATACGCT GCAAAACAAA ATAGTTAAAT TTACTAAATT AAAGAGGAAT 960
GTTTTATTCA AATATATTAC TAAAAGTTGA GTATAGGCCT ACTTATTAGA AAAAGTTATG 1020
TGAACTCATA AGCTCACTAA ATTAAGAATG AGTAACAGAA AAGTGAAGTT TCCATTAAGC 1080
TTTCCATTTA GGCTATTAAT GAATAGTTTA TGAAAAGTAA GTTTGACCTA TTTATACAGT 1140
ATTAATTAGT TTACAATCTA 1160