EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-13016 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:18703741-18704694 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr16:18704526-18704536TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr16:18704526-18704536TTTAATTAGA-6.02
Alx1MA0854.1chr16:18704138-18704155TGATTTAATTAATCAGT+6.36
Arid3bMA0601.1chr16:18703862-18703873ATATTAATTAT+6.02
CTCFMA0139.1chr16:18703969-18703988TGGCCACCAGGGGGCCCCC+6.93
CTCFMA0139.1chr16:18704204-18704223CCGCCACCAGGTGGCGCTT+7.24
CTCFLMA1102.1chr16:18703973-18703987CACCAGGGGGCCCC+6.43
IRF7MA0772.1chr16:18704012-18704026ATTTTCGTTTTAGT-6.16
LMX1BMA0703.2chr16:18704139-18704150GATTTAATTAA+6.02
Enhancer Sequence
ACATTATAGC AGAGATGAAG CTAAAAATGC GTCTAAACAC GGCTGTTTCC ACAGAGCTTC 60
GTCTGTTTCT GTATTTGGGA TCCAAAGGAC ATGACACAAA CACAGAAGTG CCTTTAGTTC 120
AATATTAATT ATGTTCCAGA GAATTATAAA ACACACAGCA AGCATGATTT GACAAAACAC 180
AGAGCCGGCC CAAGGCATAA GCGAACTAAG CGGCTGCTTA GGGCCCCGTG GCCACCAGGG 240
GGCCCCCAAG AGTGCTTGAA ATTATTGTGT GATTTTCGTT TTAGTTTGTT GAGTTGTGGA 300
TTAGTGGTGT GACAAAATAT ATGCCCATTT ATAGTGTTAT TTCTGACCGC GATACATACT 360
CAGGCGCCAA AATATTTACC TAAATTTACA AAAGATCTGA TTTAATTAAT CAGTTTTCCA 420
CACTGACTGC AGCAGATAAC CGCTTTAGCT ACAGTACACC CAGCCGCCAC CAGGTGGCGC 480
TTCCCGTAAC AGCGGTCGGT GGATCATGGG ACATACATCA GCGTCGTGTA AACAACAGAC 540
AGACAGATGA GCTATTGCAA TGGTGAAAAT CTCAGGCATA CAAAAACTTT CTTCTGTCCA 600
AGCTGGGCCA ATGTATTTGT GTGTTTCAGA CATCCAGCTC CCCCGAATAT GCCACTAGTT 660
TCTTTCTAAC AGACGCGCTT TCACTTTGCA ATCGCTCGCG CGTGCCCGCG GCCAGTGCAA 720
CTTCTTATGT GCTCAAACTT TTTAACTCCG CCAAAATATT TAAAGATAAC AATAGGACAT 780
GAACATTTAA TTAGAATGGC CTTTTATTTG ACTCTTACAG AACTTGTCAA AGTCTTTTAG 840
ATGGTATTTT GGCAAAAAAA TATTAGGGGA ATTAAATAGA TGAGTAAATA ACTAATGTTC 900
TCCATGCACT GTTGAAAACA TACGTGCTCA AAGGAGTCTG TGCTCACCTC TCA 953