EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-12648 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:7889758-7891322 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr16:7891099-7891114TTTTAATAATTAATT-6.31
Hoxa11MA0911.1chr16:7889973-7889985GGTCGTTAAATT+6.32
Lhx3MA0135.1chr16:7891102-7891115TAATAATTAATTT-6.25
RFX2MA0600.2chr16:7890675-7890691GGTCACTATGGTAACA+6.03
RFX2MA0600.2chr16:7890675-7890691GGTCACTATGGTAACA-6.09
RFX3MA0798.1chr16:7890675-7890691GGTCACTATGGTAACA+6.02
RFX3MA0798.1chr16:7890675-7890691GGTCACTATGGTAACA-6.16
RFX5MA0510.2chr16:7890675-7890691GGTCACTATGGTAACA-6.08
Enhancer Sequence
CAGCATTTTA ACGCTAGAAA GCATGTTTTA TGCAGGAATG TAACTGATAT GCTGCATCGG 60
CCCCTTTAAG TACGAGGTCA ATGTAACGAA TTTTGACGCT CTCGCCGCCG GAGCTGAAGG 120
CAGACAGCGT TGTCGCCAGG GCTGCCAGAG TGACCTAATA ATGCGCATTC ACACGTTTGT 180
GACTTAAGGA GACGTGGCTT TGAAGGGCAG GGAAGGGTCG TTAAATTTCT AAGCTATTAT 240
GCTAATGCTA GCATTCTGGC AGATCACCTA CTGCACCTTT AAGGCAGCGT ACAGAAAATA 300
AACATAACAC CAGCAAAGAA ACAAGACACA GATGAACATA AATACCCCTA TTGCCGACTA 360
TTGTTTGGGA AGTGTTTTTG CAGAGCAACA ACAAACAGCA CGCAGAAAAA TAAATGCACA 420
GCACCTTGCA AGGTATGCAC CGTGGATCAA AGCGATCACT CGATGCAGAA GTATAAACCA 480
GGCTTGAGCA TCAAGCCCTG ACATGAGCTG CTGAATCATC AGAGCTGAGA GCTTATTAAT 540
ATTCACGACC CTTCCAAATA TGGTCAAAGC GATCCATACA ACAGGGTTTA AAATGGACCT 600
TTAAAACCAA TTTTGGAGAA TCCTTGCACT TAACTAAGCC ACATACCTTT TATGTAGTAA 660
TCAGAAAACA ATTTAACATA CTGCATCAAT AAAACAAACA AATATTATAG AAACAAATGA 720
TGGAGAACTG AAAGATGAAT CATGCGCAGG GTAATTGATT AGTTTTAGTG ATGAGCGGTC 780
AAACACTGAC TTGTCTTTGC TCAGCATGCG TCTGCGGGCC TCGTGAGCCT GACTCTGGAG 840
GAAGTTCTGC AGCTGGAGGG TGTCACACAT GGTGGGGATG ATGAAGTGGC CCATCTCATG 900
CAGGCAGGGG GTGGAGCGGT CACTATGGTA ACAGAATAGA ATAGGGGAAA AAACAACAAT 960
GATTGACGGG ACATTAAGCA GCACAAAGAC TTCTCGGAGA ACAGTGAGGA GACGCATCAG 1020
TCAGAAATAC AACAGAGCCA CAGGAATAAC ATCTTACCAT TCATCCGCAA TCTGTTCAGT 1080
ATGATCTCTG CTGATGCGCA TTACTGATAC TATTCTGACT TGTAGGATTT CAAGCTACAG 1140
CGGTCAAGTT GTCATGAATG TAACTCTTCG GATTACTTTT AGAGCCTGGT CACATCAATA 1200
ATGAAACCTA TGACAAGTGC ATATTTTATT GACATATCAT TATATATACA CTTGAAGTCA 1260
GAATTATTAG TCTCACTGTG TATTTTATTT TACAATTTCT GTTTCACAGA AAGATCCTTT 1320
CAACACATTT CTAAGCAATA GTTTTAATAA TTAATTTCTG GGGGGGGGGG TTCGCCTACA 1380
CAGTAGGTTC GCCTCACAGC AAGAAGGTCG CTGGTTCGAG CCTCAGCTGG CATTTCTGTG 1440
TGGAGTTTGC ATGTTCTCCC TGTTCATGTA GGTTTCCTCT GGGTGCTCTG GTTTTCCCCA 1500
CAAGCCCAAA GACATGTGGT ACAGGAGAAT TGGGTATGGT AAAATTGACC GTAGTGTATG 1560
AGTA 1564