EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-12643 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:7838136-7839280 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr16:7838440-7838450TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr16:7838440-7838450TCTAATTAAA+6.02
Arid5aMA0602.1chr16:7838363-7838377ATAATATTGAGAAA+6.04
EsrraMA0592.2chr16:7838304-7838315GTCAAGGTCAT+6.32
EsrrgMA0643.1chr16:7838305-7838315TCAAGGTCAT+6.02
Hmx2MA0897.1chr16:7839236-7839253ATTCTTTAATTGTATGC-6
PHOX2AMA0713.1chr16:7838437-7838448TAATCTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:7838437-7838448TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr16:7838437-7838448TAATCTAATTA+6.32
RFX3MA0798.1chr16:7838691-7838707GGTTTCCATGCCAACC-6.04
Enhancer Sequence
TTCCATTATT CTCTTAGCAA ATCACAGTAC TGACATTTTT ATGTACATTT AAAAGTATTT 60
ATGTTTTGTC CATTTGTATA ATAGTGTTTT ATAATGTTGG TAGTAGAGGT GGAATGGTTC 120
ACACAGCATA AAATACATAG CCTTATACAG TATTTTTTTA AAAATATTGT CAAGGTCATG 180
TAATAAATTT TAACTTTAAT TTTGGGGGGA ATTATCCCGT TAAGAAGATA ATATTGAGAA 240
ATGTCTCTGA AACTGGGTTA ACAAGATTTT TAGAAAGGCG ACATGACATG TTTGGGTTTA 300
ATAATCTAAT TAAATTGCTT GTATTTGGCA AGTGTAATTC CGCACCAGTG ATATTTATAA 360
TCACATCACA TTAAGTTCAA TAGGAAAAGT CAAGCACAAT TCTGTATCAT GAAAAATCCC 420
ATGTGTGGGA AGCCCATTGG GGGTGTATTC AAATGTTCCC GGCATGTTTG AAAAGCCGAA 480
GCACATAAAC TGCAATTGGA ATTCCTTCCC TTTAACAGAA ACCTCTTCTG CTTTTCACTT 540
TCAAATTCAC TTCGAGGTTT CCATGCCAAC CAACTCTGCG TCAGTGGAAA AGGACGGATC 600
TAAACAGCCC TAATGGGTGC TGTTTTCTCC CCCCACCGAG CCTCTTTGAA GAGCGTCAGA 660
GAAATAGAAA CATTTCCTCT GTGAGCGGCT AATGATACGC CCAGCGAGGG CCATCAGGGC 720
GCTGAATAGA GGCAGTAAGC GAGCGCTGGC CTGGTGTTCT CCCTCTCTTC TGTTCTCTTC 780
ATTGAGGTTG AGTGGGGGGT GAAAAGCACA GTGATGCTAA TGGAAAGTCA GCTTGATTCT 840
ACAGGCCCCC TTTTTAAAAA CTCGCTTTGC TTCCACAAAG CTAAGGGTCA TGCAGTTACA 900
ATGTGCGTTA ATGTACAAAA ATCAAGTATT TAAATCAATT TACAACAGAC ATCTATGGAG 960
CGAGTACACT GGAGAGTGCT GAAATTATTT TCCAAAACAT TTTTATTATT ATTAGTCATT 1020
CAATATCTAA TGCTTCATTT ATTTAGATAT TGGAACTACT TTTGTATTTG AACAAGTTTT 1080
AGATCTTTAT TTATTTGACA ATTCTTTAAT TGTATGCAAT TGCAGAGTTC TACCATGTAT 1140
TTTG 1144