EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-12534 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:5711991-5713380 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr16:5713011-5713022TCCTTATCTCT+6.02
IRF1MA0050.2chr16:5712626-5712647TCTTCGTTTCTTTTTCCGTTT+6.13
YY1MA0095.2chr16:5712867-5712879CAAAATGGCCGC+6.44
Enhancer Sequence
GCACCCTCTT CACATTTTCC ATATTCGTGT TCCCCACTAC ATTTACCACA CCTTTGCTTT 60
CCCTTGCAAA AAGCTGCTAT ATGTCCAAAT CTCTGACATT TATAACACCG AAGGGGCGGG 120
GGAATGTACA GTCTTACATC ATAGCACATA TACCCGATTA ATATCTTTTT CGGGAGTGTC 180
TCCTCATCAA ATGTGACCAT AACAGAAAGA CTATCACAAG CACTTCCATT TCTGTTTGTT 240
CTTAAGCGTT TAGCTTCGAC CACATTTGCA TTTGTTATGC TTGCTTTCAC TTCATCTGCC 300
GAAACATTGA CAGGAATTCC TGTCACAACG CCTTTAACAT ATCTTTTCCC GTTTGTCTTG 360
GAACATTCTA CTTTTTTTCC ATTGATTTTA TTCACCTTAA TTGCTTTAGC TTGCTGTTTT 420
TCATCTTTAC AGAAAATCAG TATCGATCCG TTTCTCAAGA TTTTTGCACT CTTTATTATA 480
CCTATTTCCT TATGCAGTGT TTTGGTTAGT TGTATCGGAT TCATACCTCC AAATGTATCC 540
CCTTCTTGCA CAGGTTTAGC AAATACCTTG TATTCCACTG TCACCGTTTC CTCTAGGGCT 600
GAGCATCTAT CCGAATCACT TTCATCAGAT TTATTTCTTC GTTTCTTTTT CCGTTTGTTG 660
TTTTTAACCA TGTCCCATTT TTCATAGTTC CCGCAAACTA CTTCCATATC TCCTACTTCA 720
TTTCCTGATT CGTCACTTCC GTCTGCATTC TCCTGTCCAC TCACATTCCA GTTGTTGCCA 780
ACCGCCTTGG AGTCTATCCG CCTTGCCATC CTCCAGCACT CGCTCTCTAC CGGAACGATA 840
GACCAGAAAC AAGAAATACA CAGAATTAGC CCTTACCAAA ATGGCCGCAG TTCCAGGTCG 900
GGTATTTTTC ACTGGCAGGC GTAACTTCCG CTCTCAACTC CTCCTTTGTC TGAGTCCTTT 960
CGGTCCTCCG CCTTGATATT TATTTATTTC CTTTTCGTTA GTGGGGTATA TTTATATATA 1020
TCCTTATCTC TCGGTTATTG AATGACATTC GATTCCGAGA CATATATGCC TAAAAGCAAA 1080
GCCCCCAAGA TGGATGATCT GGACTACAGT AAGTATCGCT GTTTGGCGTT GTGTTTAGTG 1140
CCGCATCGCC GCCGCTGTTT CCTTATAACA TATATACACA CGCGAGATGT GGAGAGGTTT 1200
CAGGTAGAAG TGCTGTTTAT TTCTTTTGTT AAACATTTGA AGCCTGAATC AAATATATTG 1260
CTGTCACATG TCGAATTTGT GCAGCGTAGT ATGTCGTTCA GCAGTCATTG TTCTGCATTC 1320
ATTCATGTTT GGCCTCCTTC GGTTGTTTAC ATCTGCTCTG TGTCTGTTTG CTTTTATCAG 1380
AGGCTGGTT 1389