EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-12516 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:5352081-5353816 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr16:5352957-5352974CTTAACTAATTAATTCA-6.19
ArxMA0874.1chr16:5352957-5352974CTTAACTAATTAATTCA+6.27
HNF1AMA0046.2chr16:5353230-5353245GGTTAATCATTGATC-6.61
HNF1BMA0153.2chr16:5353231-5353244GTTAATCATTGAT+6.62
LMX1BMA0703.2chr16:5352387-5352398GATTTAATTAA+6.02
NRF1MA0506.1chr16:5353398-5353409GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr16:5353397-5353408TGCGCATGCGC-6.32
PBX3MA1114.1chr16:5352116-5352133AGACCTGTCACTCACAC-7.01
POU1F1MA0784.1chr16:5352942-5352956TTAATTAGCATATG-6.18
POU3F1MA0786.1chr16:5352943-5352955TAATTAGCATAT-6.44
POU3F2MA0787.1chr16:5352943-5352955TAATTAGCATAT-6.62
mix-aMA0621.1chr16:5352961-5352972ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
CAAACCAATG ACGGGCGGCT GGAACTCTGC ACGAAAGACC TGTCACTCAC ACGCCAACTC 60
CAGCTTCATG ACCTCGTCGG CCAGCTGCGC TAACCGGGTA ACGTTAAGTT TATCAATTGT 120
CTTTTGATTT CGGTATTTTT TTAGGAGTTT GTCAAAAGTC CTTGTGAATT TGTTCATTAA 180
ACCTAAATTA GTATACCAAT GTAAGGGTTA AGGAAACCTT AATGACGTTA TACGTTACTT 240
GCTATTTAAA AGCAAACGGT TAAGGGTAAC GTATATGCTT TGCCTCGGTG AACCAGTTAC 300
ATACTTGATT TAATTAACGT TACATCTAAT TTATTAATTA AACTTATCAT TATGTTTTCA 360
GTGTTTTGGC TGATGTTGAG TGCTTCTCAA TGACATTTGT GATGTTAAAT AAACTATTAA 420
TTGATGACCA TATTTTTTAC TGTTTAACTT CCATGTGCGA GAAAGTGTAC AATAAAATAC 480
AAACTATGCA TGTAGTTTTA TTTACACCTG CAGTACCGAT GCCTATTTTA CAAGAAACAT 540
GTTTGGTGAA CACTTATGCT GTGTGTTGGT GCTCATTATT TACCGCGCTG AATATGATTT 600
GGTGCAAACA GGCGTTCACA ATGGTATGGA CCATTATAGG GGTGGTCTAG TGTATATTTA 660
AGTTATTTAT TATTTTAATT ATCAATATTA TTTAAAATAC AGATCAAAGC GAACTATTTC 720
TTAACTATTA CAGGGCAGAC CTCTCCCCAT ACGTCTTGTT TTGATGTCCT TAAGGGGAGA 780
TCAAGCATTA ATTAGGGGGG CCTGACTCCC CAACCCCCCT TGTTATTCGC ACCCTGGTTG 840
TAGGCTGGTT AATGTGAGTT ATTAATTAGC ATATGCCTTA ACTAATTAAT TCATAATAAA 900
GTAATGTTTA GTTTTCACAT TAGTACATCA TTATTTGTGT ACTGCTGTTA CCGGGTATAA 960
TTCACAAGCA CACCTGCCTG TCTCTTTAAT TTAACCGTTT GTCGTGTTAA AGCTCGGTCA 1020
GATACCGGAC AGCACCCGGT CCTCTATCCA GATCATCACC GGGGACTTCA TCACTGCAGC 1080
TGCAACCAGC CGGTGTGCTT TAATCATCTT TATGGCAGCA CTTTTGGCGC AATGGCTTTG 1140
TTTTCCTCGG GTTAATCATT GATCGCTGAC GTGTGTGTGT GTGTGTGTGG ACGTCTCTCA 1200
GCATTGCAGA TCCAGCATTT CCAGCCCTGG TGCTGCGCCA GTCTGACCGC ACCGCGAGCC 1260
TGATCCTGCC GCGCGTGGAT TCGGTGGATC CCGGTGAAGA GGAGCGCGTG TCCCGCTGCG 1320
CATGCGCGTC AATGCCGCTC TGACTGAACT GAGAGGAGAG AGAAAAAGCT GAGACGGTAA 1380
ATTACCACAC ATTTCTGCAT TACAGTTTCT TTATGTGACA TCTGGGGTTT ATTTAACGGC 1440
AAATTGTAAG GAAGGAGAAC AGAGAGGTGC ATGGATGTTT TAAAGAGACG GACGGGTCTG 1500
CAGTGGTGTA TAAATATGAG TGCTTCCACT GCACGTCCTA TATGAATAGT TATTATGCGA 1560
CTTTAATTGT AAGTCATCGA GTAAATGTAA TGATTTGAGG GTGTTTATGG TTTCAGGAAT 1620
GTCTGTGTAG CACAATGCGG ATGATTATTC TTCACTTGTC ATCAGTCATG ATTGTTATTC 1680
TCATTGTTTT ATTGTAATGT TATATCGTGT TACACCCATG TTGTCCTCAT ACTCC 1735