EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-12456 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr16:2904122-2905272 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX2MA0600.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC-6.02
RFX2MA0600.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.05
RFX3MA0798.1chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.03
RFX4MA0799.1chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.23
RFX5MA0510.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC-6.48
RFX5MA0510.2chr16:2904698-2904714CGTTGCTGTGGCAACC+6.68
Enhancer Sequence
TTACAAAAAA AGCAGTAATG AAGCTCTTCT CCACTTCAGT TAAAATGATA TTTAACAAGA 60
CATCTCACAT TTTAGTCTGT TATTATTAAC CTGAGCTGAG GCTTGAAATG TAATGGACCT 120
AATGTACGTT AATCTACCAG GGTTACATCC ATTAAACATC CTTTAACATC CATTAAAGCA 180
CTCTGAAACA CAATTTATTA CTCTGGTAAA AGTGTATTAT TATTCAGTCA ATTCACACAC 240
AGTCAGTGCG ACATCACATG ATCAAAGACA ATTCTCAAAG GGAAAAATAT TATTAGCATG 300
CTGCAATATT AGCCTATCAT ATTATCCAAC TCGGTGCACC ATATTGTAGC TTGCGCTAGC 360
TAATTCACTT TAGCAAGTTG GCAAAAAACA TATATTATTA CAATAATTGG GACTAAGAAC 420
GGCTGCTTTG GTGACTTTAA CATTAAAGAG TATCTCGTAT TATAGTGTGA TGTAAAACTC 480
GCTAAATTAA TCGTCTGTAA TGATGTATTT TGATGACAGA TCGATCAGTG AATGGATGCA 540
TTTTTTAAAA TGCGGGTCTC CGCCATGACG TAACTCCGTT GCTGTGGCAA CCATGGAGTG 600
CGTTCGGAAT TTGAGTTCTA CTGACTGTAA CCGAGCGAAA AACGCCATTA GTGTGAAAAT 660
TGTCGTGTAG ACTAAATGGA CGCAGAGTTT CACCGTAGTG AAGAAATCCA TACAGTTTGT 720
CGACGCGTTT TTAACACAGT GTGTAAGAAA ACAAATATCA TGACTAACCT GATTAGAAGA 780
AACGCCGTGA TGCCGGCCTC GCTGGACGTC GAACATCTAC AAGATCCAGC AGATGGCGTA 840
GCCGGGCAGG CTCAGGCTGA GGGCGGCTTC GGCCCCTCTC CTGCTGCCGC CCGGAGCATC 900
AGCCCTAACG GTAAATGTCG AAAAGAGCAT TTGTCAACAC ATTACTGTCA CACATAAATA 960
CAAACACAGG CTCTCTGAGC TGTATAAACT TCACTACAGG GCGTCTTATA TGTTTAGTTA 1020
ACATATTTGA ACACATATAT AGACTGTAGG TCGTCTTAAT GGATGATAAA ATACATGTAA 1080
ACGTCAATTA TTCACTATAT TTGGAAATAT CTTTAATTAA TCATGTGTAT TTTTAAATCT 1140
GTGAAACCCA 1150