EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-10270 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr14:41789672-41791156 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr14:41789988-41790001TAATTAATTATTG+6.39
NR2F1MA0017.2chr14:41790459-41790472CAAAGGTCATGAG+6.3
Nr2f6MA0677.1chr14:41791089-41791103TCACCTTTGACCTG-6.16
Nr2f6MA0677.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.67
POU4F2MA0683.1chr14:41789987-41790003CTAATTAATTATTGAA-6.2
POU4F3MA0791.1chr14:41789987-41790003CTAATTAATTATTGAA-6.02
RXRBMA0855.1chr14:41791089-41791103TCACCTTTGACCTG-6.01
RXRBMA0855.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.44
RXRGMA0856.1chr14:41791089-41791103TCACCTTTGACCTG-6.25
RXRGMA0856.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.29
RxraMA0512.2chr14:41791089-41791103TCACCTTTGACCTG-6.06
RxraMA0512.2chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.37
Enhancer Sequence
CACACATGCA CAGATAACAT GTAAACACAT CAGCTTTTAA CAGCATAATA CTCATGAGTA 60
CTTTTGAAAG GGCTACTTTT TACTCATACT TTGAGTAATA TTTACAATAG ATACTTTTAC 120
TCGCACTACA TTTTTAGGCA AGTAATGGTT CTTTTACTTG ATTATGATTT TCAGTACTCT 180
TTCCACCACT GTTGATTATT AATCATTGGT GTAGATATGA CTACCCATTT TCCCAACAAA 240
ATTCATCTTC TCTTATTTTG TCCTTGTAAT TCCTCCACAG CAAGTCAGCT TCTAAGAATC 300
CGCTAAAATG ATACGCTAAT TAATTATTGA AAAGCATAAA AACTATTTGA GTAACATGAC 360
TAATGACGAG GGCAGAAATA TATTGATTTT CATAGATGAT GTTTCAGCAT CCAGACTGCT 420
AATTGCAATC ACCATTCGAC AAATAAAAGA CGTGTAACTC TCTAACTTGG TATTTCAAGC 480
TCATTAGCGA TCAACATCCG ACCCCTAAAA AAAGCAGCAA AAAATGAGAT CCAGTAGTTG 540
TTGCCAGTCA AATTAAACTC GTGTTTTCTT CTTACACTCC CCGAGGAGAC TAACAAAGGA 600
TAACAAGCTC GTTCCAAATC CTTCATGTTA ACGACTAGAG TTTTGCCCCG ACAAATGCGA 660
GCTTGACAAA AGACGCAGCG ACCACTATGA TGAAAAATCT GTGCGATAAA GTGATTCAGC 720
AGCTTTTGTT CCTCGGCCTG CTGTCCCTTT ACTCTCAGGG TGTCTGATTG GCGGCTGAGT 780
GGGAAGTCAA AGGTCATGAG AAGTCTGACA AAGGGCCTGG GCCAATACAA AAGTTACTAA 840
GTGTGTCAGA TTGGGAGGGG GGTCCTGAAA AAGACCTCCT GCCTGGTCCC CTAACAAAGA 900
ACCATCAGCA TGTGAACAGC TATGAGTGTC AGCACTCCAG TTCTCCTCTC CTTCCCCCAA 960
TGCAGGGCCT CTCTCATGGC ATGCCCTCTG TTGCTGTTGG GGGATAAGCG GTAAATCGCT 1020
GGCTGGCATA AGGGAGCATG TGTGTTTTGG GGTAGGGGGT TGCTAAATGC TACGACTGCT 1080
CTGCAACAAA GAACAAATCA AAGTGTGCCT CTTGTTTTCT TTTAAAAATA CATAAAAGAT 1140
TTTGGGGAGG GATCGGGGAA CTTGTACGAG GAATGCGAGT CGGTTAATTT GGCACTGAAG 1200
CTGATGGAAG GTTTCCAGTG AAGTTACAAA TAAGGCTACT TAGTTGTGCG TCTTCGCTTC 1260
TCGAAAAAAA AGGGGGAAAA ACAGATTGGA CTATGCCAGC TATTTTGGCC ATTGGTGGCC 1320
TTAAAGGGAT AGCTCACTTA AAAATGAAAT TTCTCTCATC ATTTACACAC CTTCCACTAC 1380
TTACAATCCT GTGTTTGGGA ATTAAAACCA TTGTTGGTCA CCTTTGACCT GCACAAATAC 1440
TATACTAAAA CATTACAAAC CATAAATTTT TAAGCATCAA ATTC 1484