EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-09952 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr14:34626000-34627372 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr14:34626483-34626495GAATGTTTATTT+6.74
HOXD9MA0913.2chr14:34626691-34626701GTTTTATTGC-6.02
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.54
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.68
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.79
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.67
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.8
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.41
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.96
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.17
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.34
Rarg(var.2)MA0860.1chr14:34626561-34626578GAGGTCACTACAGTTCA+6.31
Enhancer Sequence
GTGGAAAAGA AATATTATCA AAGTAAAGAG CCACCATTAC AGACACTAAT AATTAAAATC 60
CCTTATCGTT TTTCTATTAT CCACAGCTCG TGATCTTCAT TATAGCGCAT TTAATCTTTA 120
TCGCACAGTA GGCAACGTGA ATGCTGAGTC GTCTGGTGTG ACTCTTATCA TTTCACCTAT 180
ATCCACCCCC TCTCCTCCTC TCTCGCTTTC AGTCTCTGTG CCCTCATGAT GCCACGGCGC 240
TCGCTAATCC GCTCTCCGCG GTGCACATGC TCAGTACCGA TCACTGTGGC GATCTGTAAT 300
GGCTGCGGGA TGATGTGATA CGAGTCCCGG TGCCGAGCCG CGTCTCTTCG GTAGGAATGC 360
CTTTTCCTTG AGACCGCCAA CCACTCCGTT CATTCCTCCG TCAACATGGT TGGCATCCGA 420
CAGAAGAATA ATCGTCGGAC ATCGTAGTCT CGTGCACGTG CGAGGGCGAT ATTCGTGTAA 480
GTTGAATGTT TATTTTGTGT CTGTAAATTG CGATTCATTG AGCGGGGGAT CCGGACATGC 540
GTGTGTCAGT GTTTGTTATC CGAGGTCACT ACAGTTCAAA GCAGCATCTC TAGAGAGACA 600
AGACACGCAT ATAGACGCGT GCTGCATAGA GCTGCATTTA GACATTATAA ATAACGTTAG 660
CGTGTTTTGA TTCCATTTCA GTGCATGTTG CGTTTTATTG CAAACGTTTA ACACCGGTTA 720
TCACAACGTG CTAAAGCAGC GTCGCGTTGG TATCTTTAAC GATAACCTAA TACATCTGTT 780
TCTTACGTGG GTTGTTCTTA TGTATATTAA TAGGAGTAAA ACAGAAGTTA TTTGTGTAGA 840
TGCGCTTATT TAGCACCGCA ACAGGCTCAC TGTGCGACCA GCCAGTCACA CACAATGAAT 900
TTTCAATGAG CTCGGGGGTT ACTACAGTTC ATTTCGACAG TTCCTGCTGC CTCCAACACT 960
AAAATGCATT ATCAGATGTC GTGGTGTGGT GCGGGCGGTC AGAAATGCTT CCTAAAACGG 1020
TTAAAGTCTT TTAAAAGGAT ACCAAAAACA GCAAGATGAG AAAAGGTAGA TTTTGAAGCA 1080
ACGTTTTAAT GGTTTTGAAA TGTGTCAATC TTCATAGAAG TTATTAAGAC TGGCAACAGA 1140
AATGTGTTCT CCTTTACGGG GTAGCCATAG CAACAGTAGG CCGCATGAGG GGTTTTCGTA 1200
AATTGTCTAA ATACTAAATG CTATATTTAT GTCTTCATTG AATACACAGT ATTTATTAAA 1260
GTGTATTTGC ACATAAAAAG TGTCAAGAAA ATGTGTTTTT TGCTGGTTTA AGCTGGAAGT 1320
TACTTGTTTT AGCTGGTTTT CAAGCTTGGC TAAGCTGTTT CAACTGGTTT TC 1372