EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08534 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:45814012-45815292 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr13:45814540-45814551TGCCATAAAAC+6.14
IRF1MA0050.2chr13:45814682-45814703AAAAGGAAACAGAAAGCTGGT-6.07
IRF3MA1418.1chr13:45814679-45814700CGAAAAAGGAAACAGAAAGCT+7.2
Enhancer Sequence
TCAACTGTAT ATCCCAATGG CTCTTTTAAA AAATGCATTT GCTAAAAAAA TCTTTGCTGA 60
AAAAAGGTTC CCGACCTCTG ATCTAAATGA GCGAATTGAG ATCATTAATT ATATCAGTTA 120
AAACCAATCA GCATTAAACA AACCAGTCAG AGATGATTTA AACCAAACCA GTTAAGCATT 180
GAAAGTCCAG CAAACCTGCA CATCATTGTC TAGTTAACAA CACACATCAC CGTCACACAC 240
TCTTTAAACA CACACTCACA GCTGTCAGAC CTGAATACTG CAGCACACGC CACGGCAAAT 300
CCTAAAACAC AACAGATTGG ACAGACGCAC ACAGACTCAC ACACACACAC TCCCCCTCGG 360
TGAGCCTGTG ACAGTGATAA ACGTGTCGAG TGTGTGAAAG GGACAACAAA CAGACAACAG 420
CCCATTTCCA CAGTATGTGT GTGTGTGTGT GGACACAGGA GGAGCATCCA ATTAGAGGCT 480
GGGCTCCATG CGGGGCCCGG GGCCGCAGGT TTTGTTTTCT TGAAAAAGTG CCATAAAACA 540
ACTCTCCTTA ATTGGCGCTC TATAAAATTA GCATCTGCAA GAGTGCTGGA TTTCCTCTGG 600
CCTTTGTGCG TGTTGTTGAC CTTATTCACT TTCAGTTATT TATCTGCTTT TTTTTATTGC 660
AAAAAGCCGA AAAAGGAAAC AGAAAGCTGG TGTGGACTTT CTCTTCCCCC CAATGCTGTC 720
CGGTCACGCT TCGTTCTGCC GTCTTTTGAT CCGATCGCGA CCTATGGAGA CATTCATGAG 780
CGCATCATTA ACACTTTAAG CAGGCTTTAT TTGACGCTTG ATTTTTTTAC ACTGTCGTAA 840
GATTTTAAGC CCAAAGGGAA TGGGGTAATG GCTCTCAGTG ACTTTTAATA AGAAGCAATA 900
ATGACAGATG TTGTAATTAA GCTCCGCGGA TCATTGAAAA ATGCAGATTA TTACCGTGGA 960
AAGGGACATT TAGGGGTTGA ATCTTTCTTT TAATCTAAAA TAGTTTACCC TTTAAGTTTG 1020
AAGGATACAC TCAAAAAATT GTGTTTGCTA TTTGTTCAAA CTGCTTATTT AAACTGAGCT 1080
GAATCAACAC AGGCGTCACG GTGGCTCATT GGGTAGCACA ATCACCTCAC TGCAAGCAAG 1140
TCTCTGGTTT AAGCCTCGGC TGGGTCATTT CTGTGTGGAG TTTGCATGTT CTCCCCTTGT 1200
TGACGTGTGT TTCCTCCTGG TGTTGCAGTT TTTCCCAAAC GTTCAAAGAC ATGCGCTATA 1260
GGTGAATTGG GTAAGATAAA 1280