EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08385 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:40403353-40403733 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:40403627-40403646AGGCCAGCAGGGGGAGCTC+6.65
LMX1BMA0703.2chr13:40403391-40403402TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr13:40403385-40403398TGTTAATTAATTA-6.12
Lhx3MA0135.1chr13:40403388-40403401TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr13:40403392-40403403TAATTAAATTA-6.62
POU1F1MA0784.1chr13:40403381-40403395ATTATGTTAATTAA+6.24
POU3F1MA0786.1chr13:40403382-40403394TTATGTTAATTA+6.04
POU3F2MA0787.1chr13:40403382-40403394TTATGTTAATTA+6.07
POU3F3MA0788.1chr13:40403381-40403394ATTATGTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr13:40403392-40403403TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr13:40403392-40403403TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr13:40403392-40403403TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
TCTTTTTGTA TGGCCTGAGG TTGAGTAAAT TATGTTAATT AATTAAATTA ACAAGCTGTG 60
CCTTTTTCCC AGAGCAGCAC GATAACATAA ACTTAAAAAG GTTTTAATAT TAGTTTAATA 120
CAGGTTTTTA ATCTGCCGGC AGCGAGCTCT CTGCAACTCT CACGTGGATG CCCACTGAAG 180
TTAAGCAGGG CTGCGCCCAG TCAGTACCTG CATGGATAGG AGACCACATA GGTTGCATAG 240
GAGAGTTAGG TTGCTGCCAG AAGTGGTGTC AGTGAGGCCA GCAGGGGGAG CTCAACCTGC 300
TCTCTGTGTG GGTCCTAATG CCCCAGTATT GATGGGGACT CTAGACTGCT CAGGGAGCAA 360
CGTCTTTCGG GTGAGATGTT 380