EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08338 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:39105915-39106803 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUXAMA0884.1chr13:39106762-39106775TTGATTACATTAA-6.23
RFX2MA0600.2chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC+6.22
RFX2MA0600.2chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC-6.33
RFX3MA0798.1chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC-6.48
RFX3MA0798.1chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC+6.53
RFX4MA0799.1chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC+6.09
RFX4MA0799.1chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC-6.19
RFX5MA0510.2chr13:39106506-39106522GGTCACCATGGAAACC-6.03
ZNF384MA1125.1chr13:39106036-39106048AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:39106035-39106047TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GATTCCCTTC CAGCCGCTAC CCATCTCTGG GAAACATCCA CACACACTCA TTCACACACA 60
AACACACACA TGTTTGAATT TTAAGTCTAC ACAACTTTGC TTAATTTACG TCGTTTTTAG 120
TAAAAAAAAA AAAGTAAAGC ATAGATAAAA TAAGCAATTG AAATATTAAA CTGTTTTTAA 180
GTAATTTATC TCTCATGGTT TTATTTAATG ATTAGTCTAA TATGATATAT GTGATATAAA 240
TTTTATATGC ATAATTATTT GTCCATTAAA TATTTGCTGA ATTTTGCTTT CCTTTAAGTT 300
GAGATTAAAA TATAAAAAGC CAAAACAGTT CAACATTTTT TAAATAGCAG TTTAAGTTAA 360
CATCAACAAA AATAATACTA CAGATTCAGA AATCATTAAT TTGTTAAGTC TTATTGCTAT 420
TTCAGAAACA CAACTGCTGT TTTATCAAAC GTTTGACTGA TCCATTATGT TTTGTTTTTC 480
TTCCTGCATG GATTAATGCT GTGTGATGTG AGATGTTATC GTCTCTCTGT TCGGCTCCTG 540
GTGTTTTTGC TGCATGTGGC CTCTTGAAAC CAGCTGATCT CTGGAATGCG GGGTCACCAT 600
GGAAACCTGA AAGACCTGAA TGAAAGCAGC CTGTTGAGCA GCAGCAGCCC CAGTTCTCCA 660
GACTCCACCC TCTGAAAACG GGACGACCTG GAAAAAGTAG GAAAATGGAC AATTTATCAA 720
CACAAACAAA AAAAAAGTGT GATGACAAAA AGCTGTAATT TGCCCAATCA TGAAGTATTT 780
TTGTCTGCAG TGTTTCAACT TAAGGCAAGG TGAATAGGGT AAAAACTTAT TATAATTCCC 840
CAGTTTATTG ATTACATTAA GAATTACAAA CTTACTATTA TTACAAGC 888