EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08234 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:35790570-35791706 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr13:35791511-35791522TTTTATTGCTT-6.32
CTCFMA0139.1chr13:35791343-35791362TTTCCAGCAGGTGGCGCCA+7.66
LMX1BMA0703.2chr13:35790597-35790608ATTTTAATTAA+6.62
Enhancer Sequence
CAGGAAACTG TTTGCACACC TTTAGTTATT TTAATTAAAG TAATAATTTC AGTTTACTTT 60
GTGTCATTTG TACTGTTTAA AATATGCAGT AATTTTTTAG CATAAGCAGA GTAGACCATA 120
TGCAATCCAA AAAGCACAGT TCACATGAAA AGTGAACTGT AGAGATCAGA GAATCTCTTT 180
TCAACCTTTT TTTAAAAGGT AATTGTCATC CTAATTTTCA TGTAAATGTG ATATTCATTC 240
ACATTTAATA GCTTTGACAG AGCTGTGCTC ATACTGATTA TCACTGTAGT TAGAAACTGA 300
GACCTCACTA CAGGTGGCAT TTTATTTTCT ATTGTGTATA AATCATGTGA TTCCTGACTA 360
TAAAGCATTA ATTAAATAAA ATCATTAAAT TAAAGTGAAT TTGATGAAAC ATATTCTGGA 420
CTGGACATGG ACAATATTAA AGTGTTAGTT CACACAAAAA AGACAAATCT ACCTTCATTT 480
ATTTACCCTT GACTTGTTTC AAACTAATTT GAGTTTTGTT GAACACAAAT AAGAATAGTT 540
TGAAGAATGT CGTAGACCAG GAACCATTGA CTTCCATGTA TTTATTTTTC ATACAATGGA 600
TGTCAATAAT CACAGGTGTC CGACATTCTT CGGAATATCT ATTATTGTGT TCAACAGAAT 660
AAAGTAACTG AAATAGGTTT GGAACACGTG GAGATTGAGT AACGATGACA GATTTTTTTG 720
GTCGTTGATG AACTACCCCT TTAAATATAT TGTGTTGTAT GTAATTGCTC TTCTTTCCAG 780
CAGGTGGCGC CACAAACTTA AGGTTTCGTC TGAGAACAGC GCAAACTGTA GATATTATAC 840
GTGTAAATAA TGTAGCCTAA CTGAACTGAA CGAGGAGCAG AGAACAGCGC AACAGAATGA 900
CTGTATAATG TTATTATTTA AAACACAGCA TAACACCACT TTTTTATTGC TTTGCTCAAG 960
CAATGTGCAA CAAACCCACA AAAACAGCTT AGAAGCGTCG TGTCTTGTAT TTACGTCACA 1020
GAGGAAATCT CCTAGTCAAA AAAAGCCCCT TTCACACATA CAGACCTTTC CGGAAAATTG 1080
CCGGCAATTT TCCGGAAAGG TTGTATGTGT GAACAGGTCC TTTTTGAAAA TACCGG 1136