EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08231 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:35769657-35770405 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT-6.02
FERD3LMA1485.1chr13:35770356-35770370GCAACAGCTGTTGC+7.34
FERD3LMA1485.1chr13:35770356-35770370GCAACAGCTGTTGC-7.34
GSX1MA0892.1chr13:35769701-35769711CCTAATTAAA+6.02
MSCMA0665.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr13:35770358-35770368AACAGCTGTT-6.02
Tcf21MA0832.1chr13:35770356-35770370GCAACAGCTGTTGC+8.12
Tcf21MA0832.1chr13:35770356-35770370GCAACAGCTGTTGC-8.12
Enhancer Sequence
ACAGCAAACA TTATTCTCAG ATATTTTATA AATCATCTAA TGCTCCTAAT TAAATGTAAA 60
AAATAGTTAT AAAACCAAAT GATCACTGAA ATGTTGAACA AAGAAATGTA AAATCACCAT 120
ATGGAAATTT AAGAACAAAC ATTTATATGC TTCAAATTGA CCCAGAAAGC AAATATTATG 180
TTCAGATGTT TTATAAATCA TCCATGCTCA CAATTAAAAG CAAAAATTAA ACTAAAAGAT 240
CACTGAAATG TTGCACAAAA AATGTGAAAC CACCATTTAG GAGCTTTAGA AAATAATAAA 300
AAATTGTAAA AAAGCGAGTA TTATATTCAG ACATTTCTGC TTCATGTGGA TTTAAGGTGT 360
GCCATCACAA ATTCAGTAAT GATGCACCCT TGCACCTAAT ATATCCAGCC TGCATAGTTT 420
TCCTTTAATC TAATACTGCA TTCAGGCAAA CTGTAAAAGC ATAAATGACA ATGCAATGAC 480
ACTGTAGTGC TGCTGTGATA ACTGAAGCTT TTCTCTGATG AATCTCATTA AAGACAAAAC 540
CCCAAATAGA CAAAGACCCC CACTAATGTA AGACACCCCT CCCCTCATAC AAGCTTTTCA 600
GCCAATCACA ACACAAAGGG GCGGATTCAA ATGATGCAAC TGGGAATAAA GCTTCAGCGG 660
AAGGTTCTCT CCATTCACCT GAAAGCACAT TCACACAATG CAACAGCTGT TGCTTACAAT 720
CTTCCACACT GACACACATA AACACTTG 748