EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08127 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:33671044-33672137 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr13:33671051-33671072CTATGAAAAGTGAAAGTAGCA-6.13
PBX2MA1113.1chr13:33671138-33671150TTGATTGACAGC+6.32
POU3F1MA0786.1chr13:33671412-33671424AAATTAGCATAA-6.37
POU3F2MA0787.1chr13:33671412-33671424AAATTAGCATAA-6.22
POU3F3MA0788.1chr13:33671412-33671425AAATTAGCATAAA-6.87
POU4F1MA0790.1chr13:33671776-33671790ATGAATAATTAATG+8.42
POU4F2MA0683.1chr13:33671776-33671792ATGAATAATTAATGAT+7.84
POU4F3MA0791.1chr13:33671776-33671792ATGAATAATTAATGAT+8.35
Enhancer Sequence
AATGTTTCTA TGAAAAGTGA AAGTAGCAGC TGCACAGAGC CGATCTCAAA TGTGATGCAA 60
GAACTGTTTA AGAGAATTAA GCTTTCACAT TATTTTGATT GACAGCACTT TGAAATTAAT 120
GTAAAAACGG CCGCATTCAC ATACTTTCCA GTAAAGCTTT ATGCGTCTTT TGCCGCCCTT 180
ATGCAGCCTC TGAATCAGTT TAACGGTGCT GAGTGACGGA CACGCTCCAT AGTGATAAAG 240
ACGGCTTCTA TACACGCGAT TTGAAGAGGA ATGAGAGCGG ATACTTTAAG ATTCAGGTGT 300
GTAAATAGAA AAAATATACA CAATAATATG TAAAGATGTT TTATTTGAAA CACAAGTAAT 360
ATTATCTTAA ATTAGCATAA ACAAAACAAA TCACAGAGGA TCAAACTAAA TTCATTTGTT 420
GCTCTTTAGT AAATAACTAT AGTAACTGTA ATCAACATTT AAATGCAGTA AATAAAAATG 480
TTCTCTTTTG AAGCTGACGG TCCATGAATT TACGACAAAA GCCTTTACCA TAAAGTTAAC 540
TTTACACCAG CTTATCATGG CTTTAGCCTA TAGAAATATA GTGTTTTTCG CAAACTATAC 600
AGGATGCAAA TATGCGATTT CGGACGCAGT TCAGGTGTGG CCGTGCGTCA CTGTCCCCCT 660
GCCTGGACAA AACCACCTTG TCTGCATTTA TGTTAAGTAA AAGCCCATGC ATGCAGTGAC 720
TGAGTGGCGA TAATGAATAA TTAATGATAT GGCAGCCCGT TGCTCCCAAA AACATTAGAA 780
GTTGATTAAA AGTGTGGTAA TATAAGCTTA AGCTTACCAA TTCCTTATTA TCCAATTTGT 840
CATGGCAGTT TTTATTTTAA GGCATTGTTT GTTCTCTTTT TGTTTTCTAT TTTGCGCTCC 900
ACGTCTCTTT ACTCTTCTCT CCATTTTGAA CATGTGACTG TAACCGAGCA ACGGATCAAT 960
CTAATGGTCA ATGAAGAGGG AGGGGTGGTA TAATTTTTTT ATTTAATAAA ATACAATTGT 1020
ATATTTATAT AAAATGCAGG ATAAAATTTT TTAACCTAAA ATATTCATTT ATTTTGTTTA 1080
ATATGTATAA TAA 1093