EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-08072 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:32042189-32042991 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr13:32042671-32042687CTTAAAGTAAACAAAG+6.23
FOXB1MA0845.1chr13:32042399-32042410AATGTAAATAT+6.32
FOXC2MA0846.1chr13:32042674-32042686AAAGTAAACAAA+6.62
FOXE1MA1487.1chr13:32042650-32042665CAGTAAATAAACAAC+6.08
FOXP2MA0593.1chr13:32042675-32042686AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr13:32042672-32042689TTAAAGTAAACAAAGTA+6.92
LMX1BMA0703.2chr13:32042781-32042792AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr13:32042785-32042798TAATTAATTATTG+6.39
Lhx3MA0135.1chr13:32042782-32042795ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr13:32042780-32042791TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr13:32042780-32042791TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr13:32042780-32042791TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr13:32042780-32042791TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
GGACAGTTAA TAATCTGTTG GTGTTTCCCC TGTAAAATCA CATACACACT GAACGGATTG 60
CATTTTCATT TTCAAATTAG AAGCAGATTT GGTGAACAGA CTCGGCCTCC CCACTGAACC 120
ACAGGGGAAT GTTTTTCTTT CTCCTATTCA CAGCGTGAGA GTTCACCCTC CTACAGGGAC 180
GTGTTTGCAT GTTTTTGTAG GTACAGCTCA AATGTAAATA TGACCCCCAA TGTTTGAGCG 240
ATACCTCTGG CTCCGAGTGT CTGCTTCTGT GTGTGAGCTT GATTTAGGGC TTCTCTGTGA 300
TTTGGTTGAT TGGGGTCAGT GGTAGAGATG CTTCCCCACT GACAGCCTCC TCCGCCTTTC 360
TGCTCCTGTA GAGTTTAAAG GGAGGTTCAG CGGAGCGAAG GTGTGAGCAA TTACTGTCTG 420
ATTATCTCTC AACTAAAGGC TTGGATTACC ATAGATCCTT ACAGTAAATA AACAACATTT 480
TACTTAAAGT AAACAAAGTA TGAGGGAAAA ATAAATGGAT ATTAACCTAC CTCAACCAAA 540
CAAAAATGGC TAATTATTTT CCATATTGTA TAAAACAACA ACAAATAATG TTAATTTAAT 600
TAATTATTGT TGCTGTCATT GTTGTTAAAC ACAACAATAA TAATAAAATT GTCAGCTTTA 660
TCAACATTTA TGCAGCTAGT TATTTTTCAA TTTAGTATAA TCTTAAAAAA CTAAAACTGT 720
ACTTTCAATG AATATACACT CACTGGCCAC TTTATTAAGT ACACCTTACT AGTACCGAAT 780
TGGACCCCCT TTTGCCATAA AT 802