EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07936 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:29223070-29223982 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr13:29223720-29223731TTAATTAATAT-6.62
HOXD10MA1506.1chr13:29223392-29223403GTTTTACGACT-6.02
HOXD12MA0873.1chr13:29223392-29223403GTTTTACGACT-6.32
POU6F1MA0628.1chr13:29223719-29223729ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:29223719-29223729ATTAATTAAT-6.02
TP63MA0525.2chr13:29223961-29223979GTCATGTGAGGACATGTC+6.14
ZNF384MA1125.1chr13:29223562-29223574TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
ACCGGCTGTC ATTTGAGATG CTGCAGTTTA GAGTTCAAAG TGTCCTGCTG CAGTGCGCGT 60
GCATGCGGAT TAACGAACGG ATTTGACGTT GCAGAGAGAA TATAGGACAC CGAGACCTAA 120
ACTCCAGCCT GAATCAAACG ACAGACAACA TCTGAACTCA CGCGAACCAT CTTCATCTGC 180
GAGCAGCTCA AGGTGAAATT TAAATGTTAT GCCATTGCCA TAGAGATGAC GCTACAGTAC 240
GTGAACACTG TCGTGTGTCG CGCGCATGGA AACACACATA ACCTTGACTG GTAACAGCTG 300
TAACCAATCG ACCAATCCAT GCGTTTTACG ACTGTCCCGT CAGCTCTTAT ATTTGAATCG 360
CACAGGCTAG ATATATTGGA AGTGATTGGG GTAGCGGACT TTGACGTTGC TCAAATCAAT 420
TTGTCATTGA AAGGTGAAGA TGTCCTTTCA GTAAATCGCC GGTAGTTGAA GCTCTGATAT 480
AACGTAAATA GATTTTTTTT TTTTCAGTGC GATATATAAC GTTAGTAGCC TAATCCATGA 540
GAGCATCTGA TGAGTCAACA AAGGAGGATT CTATTAAATA TGCTAACCTT AGTACTTGAA 600
AATTATTAGA GTGGTATAAT CATGTCATGT AAATATTAGC CGATTATTTA TTAATTAATA 660
TAATATTGCC CAAAACAGTT CTCATCAAAA TGATCAGATG GCCAATCAAA TAAAAGAAGG 720
TGGAGCCTAA ATCACAGATC ATTGGCAAAA GTAGATTTTC AAGATGCTTC GGTTTTTTAA 780
CAAAGAAAGA GTATAAGGGA AGACGATATC AGCCTTATTT TGCATCATTT GTCGTGTTTT 840
GTGATGGAAA TGTGAAACCA TCAACATTAC TGGACTTTCA ATTTGATAAA TGTCATGTGA 900
GGACATGTCA AT 912