EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:28340569-28342407 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr13:28340678-28340689ATATTAATTAA+6.62
Gata4MA0482.1chr13:28341264-28341275AGGAGATAAGA-6.14
NEUROD1MA1109.1chr13:28340819-28340832AGACAGATGGCAG+6.78
Enhancer Sequence
TCAGATAGAG AAAGAGTCAG CGATGAACCT GGAAAGGTCT GTGAGGGCGG ATTCAAACAC 60
GGGATGCCCA AAGGGCAATG ATGCTACACT GTAAAGTTAA GAATTTGAAA TATTAATTAA 120
AAGTTTTTTG CTGCCTATTG AGTAAGTTAA ACACACCTGT TTAAGTTTTG ATGCTAATGT 180
CAAGTTATAT TAACTTAATA TCTTTAGTAA TGACAACAGC GGGGTTTACA GTATATAATA 240
CTAGACTACT AGACAGATGG CAGTTTCTCG TGTCTTTAGC TAATAATCTT TTTAATAATG 300
CTCACAACAA CTTTAAACTA TCTTTCTACG GTAAAACAAA AAACATTATT TCAGTGGCAT 360
ACAGTTCCTA ATATTACTTT TTATTGTCTA TTTAAACATT TTCATACTCA AAATGGCAAT 420
CCTAAAACTC AATTTTTAAT CCAGATTAGC AGCTAGTCTT AAAAATACCA CAGTTAAACT 480
ATCCTCAAAG CATAAAGTAG CAGTTCTCAT TCATCAAGGG CCATGTTGAC ACATTTAACA 540
AGTCCTTGTT GAATTTAACA GGCCCTCTGT TCAGTAGGCA ATCCAGCAGC ACTTGATCTC 600
CGGCCCCCGT GAATGAGCTA GTTAGCCATA TCACTTAATT GGGCCTAATG GAACACGCAT 660
CATACCCAGC TTTATCACAC ACAGTATAGC TGCTGAGGAG ATAAGAGCTC TTTGGTGCTC 720
GCTGACTATT TAGTGCCTGT AATCTGCTGT TAGAGACTCT TTGACTCGTT TATTCAGATC 780
TCAATGTGCT GTATGAACAA GAGAGCAACC AGATGACTGC TGTAGGGAGT CCACTTAAAG 840
ACCATTTGTC ACAAAGCACA GCAAATAACA ACAACAAGCT ATAATAATAA GTACAATAAC 900
ATTCACAGCA GTCATTGTTT ACTAAGTTGC CCTAGTTAGA CGCACTAGAA TGTTGCATGG 960
TTTTTGTAGC ATGTCAAATC TGTGAGGATT TATGGAAATT CTCCGAATGC TCAAAGCAAT 1020
ATCAGATATT ATTTTAACGC TTAAGACAAA GTCCAGTGGA TTTATTCAGA ACAAGGCCTG 1080
AATAGCGTCT AATTGGTTCC CCAGGTTGTC TATATAGGTA ACATCTTGTT TCCATGCTAA 1140
TGATGCTGTA GTGTGGTTTT ACAGCTGCAG AGGGACAGCA GAGGTTACAG GGTCAAGGAA 1200
GGCGTGAGGG TGGCAGGGGA TCCCCATGCT TGTGTGAGAC TGACCTCAGA ACAGTTTATA 1260
TACACCGGAG GTTTTACAGC CGAAACATTT GGGTTATCTG GTGTTAGTTG CACGTGGTGT 1320
TATGTTAACC TGACTTATGA CTTGAAATGA CATGAGAGAA TTTGGCCATT CTCTGGTCTG 1380
AGCACACTTT AGCAGACCCA AGCGCTTTAT GATTATATCT AGACTTTAGC AGCAGATGCG 1440
AAAGCAGATA TATGTTCTGT TGGCTACAAG ATGGACATAT GGCCACAAAT GTGTTCCTTT 1500
ATCAACTGAA AATTGGCCAA ACTGTGAATC CAGTGAGCAT CAGACGCACC AAGTCCTTCA 1560
CAAACAATTC AAAAGTTGCA TATGGACCTG ACATGCTTTG TATGGAAAAA TAATTACAAC 1620
CTCCTTTGAA GAGCACTATA TAAACACAAG CACTCTCTAC ATGCCGTTTT CTCCTTTCAA 1680
CTTTGCCTTT CCTTAAAATT CCAGCAAGAT TTGCACCTTC TCTGCTTTTT CAATCTGTTC 1740
ATTCTTTGAG TCTGCTTCCC TCTTTTTCTG TCCTCCTTGC GTATATGGTG GCTTTCTCTG 1800
TTCATTTGAG ACAATATGAA TATTCATCTT TAGTGTTC 1838