EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07832 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:26768325-26769349 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr13:26769054-26769066TAAGTAAATAAA+6.07
Hmx1MA0896.1chr13:26769196-26769213TTTAATTAATTGCTGTT-6.01
Hmx3MA0898.1chr13:26769196-26769213TTTAATTAATTGCTGTT-6.02
LMX1BMA0703.2chr13:26769194-26769205AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr13:26769193-26769204TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr13:26769193-26769204TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr13:26769193-26769204TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr13:26769193-26769204TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TTATTTTATA AATTAAACCC CAAAATAAGT AACACATATT TTGATTTCAC AATAAAACAT 60
GATGGAATAA CTATTATTTC TGACAATAAG ACACTTTTTT GTGTATGGAC AGAAATAATT 120
ATATTGTTAT TATCAAAAGA TGTTCCAGGC CATAACAAAG AGTGACAAAT CATTAAAACT 180
ATTAAAAATA TATAACCATT TAAAAAAGTA ATAACTTTGG ACACCAAATG TAAATGCAAT 240
TATAGAATCA CCCATTATAG AGAACATGTC AAACTAAAGA ATGTCACCAT TATTCTTATA 300
AAAGAAGGTT TCACCTCATT CTGTGTCACT AAAGCTTACC TTTTGACTCT CAGATCTTGC 360
AATCCCTCAT TCTTTTTCTT CTCGCTCAGA CTCACAAACA CAGTTGCATT TTAAAATGGC 420
AAATAAGCAG GGAATTCCTC CAGTGGCTGG TCAGGAGGCG TCAGTATTGA TCCAGGGGCT 480
CATGAATATG AAAAGGCCAG GCAGGGTGAT CAGATAAGTG GGCTGCCACT GCCCTCGCTG 540
TCTCTGTTCA TTTTTATACT GCTTTTCATT CTGAGCAGCT ACTGAGCAAT AAAATACAAG 600
CTCAGGGTGA TGATAAACCT GAGGTTGTCC TGATGAACAA TTCAGAAACT ACTGTTGAGG 660
ATAAAATACT ACATTAACCA TGATGTTATA TGTATCTTGT GAATTCCCAG TTAAATGGGA 720
ATTCTTAAAT AAGTAAATAA ATAAATAAAT AAATAACATA CAGTACATAC AAACAAAATT 780
CTATAATTAT TTTGGACAAG TTTAATCTCT TTCAATTGGT ACAGTTAATT CTGCTTTTAA 840
TCGCTCTTTC TGTCTACATG CTAAAGTATA ATTTAATTAA TTGCTGTTGC TTATTTGGAA 900
AAAAGTAATA CTTTTTGATG TTTCTGTTTG TATAGAATTG TAAAAAATGA GTCGATAGTC 960
AAAATTGAAA TTGGATCAAA GTGTTTTTAA ATTGTTCTGA CAAGAACAGA CTTTTAATTT 1020
ATTT 1024