EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07829 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:26684794-26686445 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr13:26685491-26685501TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr13:26685491-26685501TTTAATTAGA-6.02
Arid3bMA0601.1chr13:26685752-26685763ATATTAATTAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:26686025-26686035GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:26686025-26686035GTCACGTGAC-6.02
LEF1MA0768.1chr13:26686353-26686368TACCCTTAGATCTTT-6.03
MITFMA0620.2chr13:26686021-26686039GTAGGTCACGTGACGCTT+6.14
MITFMA0620.2chr13:26686021-26686039GTAGGTCACGTGACGCTT-6.14
RORA(var.2)MA0072.1chr13:26686016-26686030ATTAAGTAGGTCAC+6.05
RORCMA1151.1chr13:26686017-26686029TTAAGTAGGTCA+6.52
USF1MA0093.2chr13:26686024-26686035GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr13:26686021-26686037GTAGGTCACGTGACGC+6.38
ZNF384MA1125.1chr13:26686309-26686321TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr13:26686311-26686323TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TTCCATCAGA AAATGGACCG TTTCTTGTTA GACGGAAAAT TGTAGGTCTA TACTGTTTTT 60
GAGTAGCTTG CTTTAACTCA CTCTCAAGTC TTCAAACAAC CTGAGACTGG AGTAAAAGAC 120
CACATATCCA GGGCAGAGGA GGACAGTTAG CGCGGATGGT GGAGATAATG CTTGAAAAAT 180
GATACAACAG CAGAGACTAG TGGTGAGACG GAGCTTTGTG AACGCTCTTC CTATTTCTTC 240
AACCTCCGCT GTTCCTCCTT TATAGCCTTG ACCTTTCCCA CTGTTTGCTC AATGATCTAA 300
GTTACATTTA TAACAGATTA GGCTGTAAGG CGGGAGGTCA TTAGGGAGAG GTCTCCCACA 360
ATATACACAT AAGTAAACTT TCTATACTAA TGAAAAACCG ACGGGTCGTA ATCCCTATAT 420
GAAAATTCTT TAATGGATTG TGTTGACTTG GCGGTTCTAT GAAAAGTTAT AATTAGCATT 480
TTAATATGTC GGGTTAAACC TCTGTGTATT CACTTTCTGT TTGTTCATTA ACAGATGTGC 540
ATATAGCTAG TGTTACTATA TTTAGATCTA TTACAACTCA TTTGATTTTT TTTTACTTTA 600
AACAAAGTTA TGTTTCATTT TTAGGAACAT TTTATAGATT TTTCTCTCTC TATCGCTGTC 660
ATTCAATCGC AAGCAAACAC AGGAGATAAA GTAAGGCTTT AATTAGAGAT GTGTCATTAA 720
AATATCCTCT CTTTCCAGAG ATGGTGGGGG TTTGCTTCTG GATGGTTGGG TGGGTATTAA 780
CAAGTTCATG GATCTTATTA CTTTCTCCCT CCGTTGCATG CTGTCAGCTC CTAGGGATAT 840
GATATCCGAT GGCTGGGCTC ACATTTACAA CAAGTTCATT ACGGCACGAC TGCCGCTCTT 900
TCTGCTTGGG CCCAGCTGGT TGGAGGGGTC TGTGTTTTAA TTAGTGCTGA GGGTGTGCAT 960
ATTAATTACA ACATGAGTGA TATTTACTGT ACCTAAGGAA CACAGGACCG GCTAAAGACA 1020
CTGGCAGCCT CAGCTAATAA AGCCAGCCAT GCTAATGAGC AAAAGGAACC ATAAAAATAG 1080
ACGGCGGCAA AATAATTCAT AAAGTTTATT GATCTCGGAG TAAAGACGTT AAGCTCCGAT 1140
TAAGGGCAAC AAAAGGAAAG GCATCGCACT TTATCAAATA AATAAGCCGA GTGGAGAAAT 1200
GTGAGCACGG AGACAGATTG TCATTAAGTA GGTCACGTGA CGCTTTTCTC CAGAGAACGG 1260
CAAATATTCG TTCATGCGGT GAAAGAATAA AATAAAGGAG GGGGAAACAC TAGAGTTTTC 1320
TCATAAATCG GATGAACGTA AAACTGCTGT TGGTCTGATT GTCAAAGACA TTTGTGATTC 1380
ATCTAAACGC AAAGACGTTT CTTGTAACTG TGCACAAGTT TCAGGTAGGC TATTCGCAAA 1440
CTTTTATTAT ATTTTTATAT TGTAAGTTTT GCTTGAGGTG TAGTAGGCTA TTCTTTAAGA 1500
ACAGTACAGC CAATATGTAA AAAAAAAAAG AAACATATGC ACTTTCCCTT TCGAAAAAAT 1560
ACCCTTAGAT CTTTGCAGAT AGTATTTATT TATACAGCCT AATCATTTTT TAGGAGTTTT 1620
TCACCTTTTA TTGGACGGGA CAGTGGAACG T 1651