EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07807 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:25924136-25924902 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr13:25924414-25924431TGACCCTTATGTTACCT-6.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr13:25924414-25924431TGACCCTTATGTTACCT-6.26
ZIC1MA0696.1chr13:25924356-25924370AACAGCAGGGGGTA-6.24
Enhancer Sequence
AGTTGACTTT TACTTCAGAT ATAGTTCACA TGATGTTCAA ATGTTCCTGT AAGGATCCAA 60
AATATCAGAC CCTGAGACCT GTTATGGAAT TTCATGAGGC AAGATGCAAT GTTCCAATGC 120
ATTTTCTAAT CTGAGAAGTG ATGAAGAAAC CAACTGTTCC ACTGTTCTTT TCAAATCACT 180
GTTGACAATG CAAACACAGG CTGGAGAAAC AGAGCTACTC AACAGCAGGG GGTAATTCGA 240
AGAAGTCACC CTTCTCCTTC CACCTAAACC CCCCTTCTTG ACCCTTATGT TACCTTATGA 300
TTAGAGCACA TTTCACATAA AATGTTCAAG GTTGTAACAT GGTGTATCTT GCAGCACTAT 360
ATTCATGTTT GGTATCATTT TAAATGTCTC AGTGTGATTG GTAAAGTGGT CTTAATTTTA 420
CAGTAATATT TTACTGGTAT ATGTTGATTT GGTTTTTTGA CTTCTATAAG ATCTTGATAA 480
GATGCTCTCC CTCCTCAGAG ATGGTTAAGT CCTCAAATTC ACCAGGCCAG GGTTTCTGTG 540
ACACCTCTAT TGTCTTGAAT TTATGGCTGT TTGTTTTGAC TTGAGTATAT AAGGTAACAT 600
GTGGTATAGG ACAGGGGGAG ATCTTGTAAA AAGACACCCC ATTGCAGCAT CTCAGAGACT 660
TATGCTGCAA TGTATTTCTC TGGTCAGGTA TGCATCTATA ATTCTTTGAT TTATCTTTGA 720
TTAATGGATG TTATATTGTT AGTCTCATCT CTGAATTGGC TTCCTG 766