EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07499 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:17255594-17257502 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr13:17255697-17255713TATTGTTTACTTAGCT-6.48
FOXC2MA0846.1chr13:17255698-17255710ATTGTTTACTTA-6.92
FOXD2MA0847.2chr13:17255699-17255712TTGTTTACTTAGC-7.12
Foxa2MA0047.2chr13:17255700-17255712TGTTTACTTAGC+6.52
HNF4A(var.2)MA1494.1chr13:17257431-17257446CAGTGCAAAGGTCAG+6.15
HNF4GMA0484.1chr13:17257430-17257445ACAGTGCAAAGGTCA+6.2
IRF1MA0050.2chr13:17256047-17256068AAAAAAAAAAAGAAAGAAAAA-6.59
NR2F2MA1111.1chr13:17257436-17257447CAAAGGTCAGA+6.14
ZNF24MA1124.1chr13:17255775-17255788GAATGAATGAAGA-6.24
ZNF24MA1124.1chr13:17255767-17255780CAATGAATGAATG-6.59
ZNF24MA1124.1chr13:17255771-17255784GAATGAATGAATG-7.82
ZNF263MA0528.1chr13:17256424-17256445GAGGGAAGAGGAGAGAGAGAA+6.33
ZNF263MA0528.1chr13:17256282-17256303TTCTCCCTCCCTCGCTCCCTC-6.39
ZNF263MA0528.1chr13:17256274-17256295CCCTCTCTTTCTCCCTCCCTC-6.96
ZNF384MA1125.1chr13:17256046-17256058AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TTTAGTGCTA CTAAATAATT CAAGATTAAT TTAAGTGACT CAAACAATAG CAATGATAAA 60
TGCACAACAA AAAAGTATTA CGTTATGTGT ATTACTAAAA ACATATTGTT TACTTAGCTA 120
GTTGTTGCAA GAATATTAAA CGAATAAATA AACGAATCAT TGAATGAAAG AATCAATGAA 180
TGAATGAATG AAGAAAAAAA AATTTCATAC CAAAACCAAA ATTTGCCATA CTTGTAAGTC 240
TAATATAACT TGCAAAACAC TAAATATGTT TTAAATTGTA TCCAGTACTA CTAAACTGGC 300
ACGCAAACAT AAGCTATGCA AGACCCACAG TGTTGACTGA TCACCACCTT TCTGCAGCCC 360
TTTCACTTTG AATATAGTAA CCCTGCTTTA TAATCAGTCT AAATCCATTT CTACATTCGA 420
ATTAGTGTCT AAGTCACAAT AAGAGAAGAG AGAAAAAAAA AAAAGAAAGA AAAATCCCCT 480
GCCAGAAAGG CGAAAGCGTG AGGCCTTTGC TGGTGTGGGC TGCTAGAGAG AGAAAAGCAA 540
GCCTTTTGAT AGGGCCGCTG CAGACAAGGC AGTTGAGAGA GAAGCTAATG GCCATGATTA 600
ATGACAAAGG GCCAGAGGAG AGCGGGGACA CAGCCGCTAC ATACATCATC CCTCCCCATC 660
AGTCAGAGCA CCTCCCTGGA CCCTCTCTTT CTCCCTCCCT CGCTCCCTCT CTCTTTCTCC 720
TTATCTCAGC CCACTTCCCC ACCCCCCCTC TCCAAAACTA GAAAAACAAG TGACAAACGG 780
GTGATAAGGT GAACAAGAAA ATGGCGTGTA AAATAAGCGA GAGATATTCA GAGGGAAGAG 840
GAGAGAGAGA AAACAGCGCT GCGATTTCAT ACGACTTGAC TCTTCGTCGA CTGAAGCCCC 900
CATTCTCAAG GTCTTATCTG CCATATGGCT CCCCTGTTTA GATGATTTAT TAGGTGCAGA 960
AAAGCACTCT GATAAATTTT AGCTCGTTCT GGCTGCGTAG GCAACCCACG GTGTCAATAA 1020
CGAAACTCAG GCCACTTTAA TGAAAACTTT TAGTACAGAG GGGGTAACCA TTTATTTATG 1080
AGTCACTATA ATATTACACT GGTGGAAAAA AGAAATTTAT CTGCCCTTCT CACGAAAAGG 1140
CGGCTTTGAG TGTAAACGGC GGCGAGCAGA TCATCTCCAT ATGTCAATGC CTCCCCTTTA 1200
CCCTGCTCCC AACACATCTT TTACTTAATT GAAGCATTCA GCTGTTTACA ACTCGCGCAA 1260
AAACAGCGCG AGTTTATTTA CGACCAATTA AAGTTAGCAT TTTGAGTGAA GGCGAACCAT 1320
TATGGATCTC AGCCTCTTTG ATTCTAATTA GTTGGTGTGT TCAGGTTTTG TTTTACACGG 1380
CTGATTTACA AGGGGGCCTT GCAAATAAAT TTGCCATCAA CGGCAGATGC TGGTTTCCCA 1440
AAGAAACGAA ACTCACAGAG GGGCACGGTG GAAACAAACA ATGCGATTAC GCCATCTTGC 1500
TTTGGCTTTA AACTCGCTTA AAAGGAATTA GAGAGCAACA AATGGCACTG GTGCAGACGT 1560
TTTGATTTAT TCGCATATCA CCTCATTAAA ATGCTTGTCT GTCGTCGCGC TGCGTTTCTC 1620
TGTCCATTAA AGAACTTGCC ACAGACTGGG CGTCTGACTT TAATGGGCCA ACACTTCACT 1680
TTCAGGAGGT TTTCCCCCTT TTAAATGACT ACATATTTCA GTCTGCATAC TTTCATGTAC 1740
ATACGCTTAC GTGCACGGAA GAAAACAGAC AAGCAGTGTT CATATTTTAC ATTTCAATCC 1800
TTCGCTGAAA TGAGTGCAAC ATTTAAAGCA TCCATGACAG TGCAAAGGTC AGATTTTTAC 1860
ACTACGGCTG CACAATGTTG AAAATAATAA CACTTATAAA ACTTAAAA 1908