EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07160 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:8683285-8684273 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:8684242-8684261TACCACCACCTACTGGCGG-6.34
FOXB1MA0845.1chr13:8683659-8683670ATATTTACATT-6.32
Foxq1MA0040.1chr13:8683799-8683810AATTGTTTATT+6.02
HESX1MA0894.1chr13:8683713-8683723GCTAATTGGC+6.02
LBX2MA0699.1chr13:8683713-8683723GCTAATTGGC-6.02
Enhancer Sequence
TTTAGCCAAT AAGACAAAAA CATAGTTTTA CTACAGTAAA CTAACATTTA TCCACACAAA 60
ATAAACCTGA CTGTATTTTT GTAGTAAAGG CGTGGTTAAT TGTGTTAAAT ATGCCATTTC 120
AGCCTGCAGA ATGGCATTTC AAACTGTGGC CTAACAAAAA TATAGAAAAG AAATATCGAG 180
TTTCTGTAAT ATAAAACTAA ATAATTCCTC TCACTGTATA GTTCCTAAAG TTAGACAGAA 240
ACAAATGTAT GTTAATATTA ACAGAAACAC TCAAATAGCA ATTAATCTGA CTGATGTTAA 300
CGTTAAAGGT TTGATCAAGC TTTTAAGTAA AACAATATAT AGTTTAAAGT TACAGTACCG 360
TTAATATAAC ATTAATATTT ACATTACAGT TACATTAAGT TGCATCAATG TTAGCATTAG 420
CATCAAATGC TAATTGGCGC TACTAGCCTG TGACATACAG TAATAAACGT TACATCTAAT 480
TACACTGACT TTAATATTCA TTGGTTTAAT TTGTAATTGT TTATTTTATT TATGTTATTT 540
TTTCTTTTTA ATTCGCATTT TTCACTTAGT GAAGGCGGGG ACAGTTGACT AACGTTGTTA 600
GCTCTAAATT AGTTGACTGG AATGCTGTGA CGGTGTTAGC ATGTAGCATG TTCACACATA 660
AAATAAGTAA CGTTACAGTT CGCAATTAAA ACCATTTCCT ACCTTTTGTT GTAACTTAAT 720
AAAATCTACT GCAATTAATG TCAACAAAGA TGTTTAATCC ACAATAATTT GATCATTATT 780
CCTACCTGTT AGCGTTCACA TCGGTTCAGT CCTTATTTAG GCTAGAGTGG GTTATTTTTT 840
GTGAATGAAT CTGTGGATTT AAATAAATTG TGAGAGTCGA TTCATCCTTG ACCTATTCAT 900
AAATACAACA GTTGCTTTGT TGCTGAATAA ATGTCTTATT CACTTAGGAC AGTGTCCTAC 960
CACCACCTAC TGGCGGCTTC AGGTAATA 988