EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07148 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:8267377-8269507 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ETV2MA0762.1chr13:8267452-8267463CATTTCCGGTT-6.32
FOXC2MA0846.1chr13:8267794-8267806TAAATAAACAAT+6.04
FOXE1MA1487.1chr13:8267791-8267806CACTAAATAAACAAT+7.88
Foxq1MA0040.1chr13:8267796-8267807AATAAACAATA-6.62
GFI1MA0038.2chr13:8267756-8267768CCAATCACAGCA+6.02
RFX1MA0509.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC+6.79
RFX1MA0509.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC-6.79
RFX2MA0600.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC+6.83
RFX2MA0600.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC-6.95
RFX3MA0798.1chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC+6.48
RFX3MA0798.1chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC-6.92
RFX4MA0799.1chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC-6.34
RFX4MA0799.1chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC+6.38
RFX5MA0510.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC+6.64
RFX5MA0510.2chr13:8267436-8267452GGTTGTTATGGCAACC-6.87
Sox11MA0869.1chr13:8269335-8269350AACACTGAAATACTT-6
Enhancer Sequence
ATGTTGTCAT GTGTTGATGT ACCGCCCCAT GCTCGCACTG GAAAGTCGTA GCAGCTCATG 60
GTTGTTATGG CAACCCATTT CCGGTTAATG CGAATTCCAT TTGCTAGCAT TTTGGCCACA 120
GGTGTTGCCA TCTCTGATAA GTTATAACCT AACTTTTGTG GTAACTGAAA CATTTACTAG 180
CACTGAATGT GTTATAACAA TGAATAACCT CAGTTTAAAC CATTGACTGT TATGGAACAT 240
GAACAATTTC TGATCTTAGC AGACATTGTG ATTAGCTGTA ACAAAGTCCC TTGAAGGATT 300
TATGTATTCT ATAGTGGTTG TAGCTCTGCT GGTTTGTGGG ATATTATGGC AAATAATGAC 360
CAGGAAAGAC CAATTATTTC CAATCACAGC AAGCTATTTC TAACAGCTTT GGGGCACTAA 420
ATAAACAATA AATGACATTA CCCAGTCCTC GAAGTGTTTG CTGCCGTTAT GCAGCAGTTC 480
CTCGAACTGA ATGGTGCAGT TGGCCACAAA GTCGTCGTAG CCAATCGGTG CATCATGAAA 540
CACCGACAGC TCAATCTTCC GTCCATCGTG CACCTCCGTC ACTAACTCAT CGTGCCAGGC 600
GGGACTGTTG GTCTTCTGCT TGGTCGAAGT CTGACCCACG CGAAAGTCGT CTACGTTGAG 660
GGCGATGTAC GTGTCTAGCA GAAAGGTTTG AGTCTTAGGT CCGACGGCGT GTCTCAAAGA 720
CCAAGCTGTG GGCTTTAGGT CCAAAGCCTC GCAGATTTTT ATTTTCAGCA GACCGTTAAA 780
AACCACCATG GCCACTTTCG AGAGCTTTAG TAACAATATT CCACTTCAGC GCCTGGTTAA 840
TTATTTAACC AGTGTATGTC ACGGTCCACC GGTGTGTTTT CAAGATTGTT TTTATTTATG 900
AGATAGCGGG AAATGCCCTT CCTCGTCCGC GTGGATCTTC ATGCAGTGTG TAGAAGGTAG 960
AGGGGATCTG TTGCTATGAC CTACGGACAA CCTGCATGTG ATCTTGAAGC TGTCCAAACA 1020
CCCTGCATGC AGTCAGCAAT CCAAGTTGGA GCGAAAAGAC AGAGCTACAG CGTATCAGCA 1080
GCGACTTGAC CAGCATTCCA CACCTCAAAA CATGCCAGAA ATATATGCTG GATCTCCTCT 1140
GGGTGAGCTG CCCGTTCCAT CGACTGGCTG GAACGCTGGA CGTGTCTCCT CCGCGCATTG 1200
GGAGGAAAGT TATCTCCGCA AAAGCGTCTT TCGATGCGCT CCTGACAGGA GAAAGAGTGT 1260
TTTCAAGGGT TCCGTTCTCA CTTGCTTCTC CCAGGATCCT TGTTTGTCCG TCGGTACTCA 1320
GTTTCCTGCA GACCTGCCTC TTTTTCTCCC GACTGTATGT GTCTGAAGGC TGGTCCAGGA 1380
AATGCGCAAA ACACGTCAGT TAGTGCGCGG AGAGGGCTGA GTAAGTGCGG TACTGGAGCG 1440
GCCCTGTTGG ACCCGACGCT GCTGCTACTC TCTGGTCAAG CATCATACAC AGGCTTAAAG 1500
ATGAAGAAGG AACATGGAGA CCATATGTGA ATAATGCACC TTGCCCAAAG GCATAAAACG 1560
CAGATAAGAC GACTACAGAC CGCGTGAACG CCGTTTGTTT CTTAATCACT ATATCTTAAT 1620
ACAATTTTAG CCTAAAAGCC TATAATTTGT GAATATTCGG AAAGGCTGGT TTGTAAACAC 1680
ATTGGAATTC GTTAGGGTGT GATCCTCAGA TGTTTCAGTG CTGTACTATG ACTCCAGCTG 1740
CACTGTAAAT GATCTACAAA TGCTCCACTA ATTTTATTCT AGAAAACTCG AGTTAATACT 1800
CTAATAAAAC AAAAAAAGTT GATTGTTTTG AGCAAATTAT GCAAACATGT TGATGTTAGT 1860
GTGTAGTTGC AAAAAGAAAA GACAAAAAAA CTTAATTTAT ATACCATTTT CTATGTACAT 1920
GTAATTAAAT CTACAGTAGG ATGTGAGTTA AAAAAAATAA CACTGAAATA CTTGATCTGA 1980
AGAAAGGCTT CGGACACAGA CACAGAGCTG TGGACAACGG TACTTGGTAA TGTAATACAT 2040
TAGAGATCCA CTTTTTCAAA ATCATTAGTC AAGCAAAAGC GACATCTCGT GGTTGGAATT 2100
TCCATTTCAA CGCCAAGCCT AGTGGGTCAT 2130