EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07028 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:5433218-5434445 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr13:5434097-5434110GATTATTTAATTT-6.03
RREB1MA0073.1chr13:5433407-5433427TGTGTGTGTGTGTGGGGGGG-6.17
RREB1MA0073.1chr13:5433409-5433429TGTGTGTGTGTGGGGGGGGG-6.38
RREB1MA0073.1chr13:5433405-5433425TGTGTGTGTGTGTGTGGGGG-6.95
TFAP2A(var.2)MA0810.1chr13:5433815-5433827TGCCCGAGGGCA-6.52
TFAP2BMA0811.1chr13:5433815-5433827TGCCCGAGGGCA+6.27
TFAP2BMA0811.1chr13:5433815-5433827TGCCCGAGGGCA-6.32
TFAP2CMA0524.2chr13:5433815-5433827TGCCCGAGGGCA-6.27
TFAP2CMA0524.2chr13:5433815-5433827TGCCCGAGGGCA+6.52
ZNF740MA0753.2chr13:5433418-5433431GTGGGGGGGGGGG-6.92
Enhancer Sequence
TAAAATTTCT TAACTGTATT TTCAGGGTGA GGACCGCAGG GAAGGGGTTA AATAGTTAGT 60
TCTAACTAGT CTCTCCCCTG TTATGGCACC TAAGGCTCGT ATGGCCGCGT TTATCTGCGC 120
AGTTTGAGGG AAAAAAACAA CGTGAACCAA ACTGGCTGGG CCGCATTCAC CAGTGTGTGT 180
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGGGGGGGG GGGCAAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 240
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GACAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGACT 300
GACTTTTTCA CCCCTGAGCT CTGCCCCTCT TTTTCTTCAC TCGATACTTG CAAAACAATG 360
CTAAGCTGGA GTTGAGACAT TATTGATACG ATGCTTCGGT GCGCGGAGGC CGAAAACAGA 420
ACAACGCTGG ACCACAGAGT TTAATAAATT CTATGTATAT TTCTGATTTT CTTATGCTGC 480
AGTATTCCTG CTGGAATAAA TTGGCCTTTG AATAAATGAA CCGCCTCTCT CCCTCTTGTT 540
AACATTGTTG AGAATTTGCA CAATGGAGAT TTTTTTTTCC AGTCCAATTC AACTTTATGC 600
CCGAGGGCAT ATATTAAAAA TACATATGGA ACGAGATAAT GCATGAGCGA CGCAAATTCG 660
TTAGGGATGT CACCGCCTAG CAAGCTCGGG ACTGTAACCA CCATAAATTA TATAATAAAA 720
TATATGTAAA ATACATACTA TGGGACCTCA AATGCTCGGT GAAGTTACTT TTAACATTGT 780
TAACCATAAA CTGATCAGTA ATCATCCACG CATCTAGTTA TCCTAAACCT TTTTTTAAGT 840
AGCCTATAAA TGTATTTAAG TTTTAAAGCC CTCTTTACTG ATTATTTAAT TTTAAACAAG 900
TACAATCCTA ACCAGCGGCA TTAATATTCG ATGCGTAACA AAACATAAAC AGATTTCTCA 960
TATTTGCAAA CTTTAGAAAA GTTGGTCAAC CTACACCAGG GAATCGGACT TCCATGAACA 1020
CGTAAACACT TAATTCCTAG CCCTATTATT TAGGCATTAG ACGTCATCAA GAAATAAAAT 1080
AGGACATGTC TTCATCCTAA AGTCAATTAA AGATCTGAAT TCGCGCCCTC GAGCAAAACA 1140
TAAATTGCTC TTATCAAGTT ATATACCTGC ATACCCAGGG GTCTTCATAT AAGCCTAATT 1200
TATTTCTATC GCTTAAATTC ATCCCTG 1227