EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-07003 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:5347228-5348066 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr13:5347248-5347261CAATAATTAATTA-6.39
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr13:5347740-5347755TGACCTTTTCACCTT-6.69
RARAMA0729.1chr13:5347737-5347755TCGTGACCTTTTCACCTT-6.34
RarbMA0857.1chr13:5347740-5347756TGACCTTTTCACCTTC-7.37
RargMA0859.1chr13:5347739-5347755GTGACCTTTTCACCTT-6.97
Enhancer Sequence
CAAATTCCCA TAATAACGAA CAATAATTAA TTAGACAATA TTGTGTTTGT TTTTGTCAGC 60
TTTATTTATA CGTTTTTGTT TTATTTTATA TAAGTTATGC ATTTTTAGGA AAGTTATCAA 120
CTTTTTATTA TTGTTTCGAG ATGTGGAGAC CTTCATTCAC AAGTGTTTCA TTACACTGCC 180
AATGTTACTA GTTTTATTAT AATTTTGCAC GATATTCAAA CTGTAAACCA AGTTATTAGA 240
ATGGGCTGCT GTAATTTTGT TCTGTAATAC TGAGCATTTC TTTTTGCTAT GTTTTGGTCA 300
TCCTTGGCTC GTTGTCCGTC AGATTCTTAC AGCAAAACTG GCACATCAAA AAGAAACGCT 360
CCCATAGACC GAATTACAGC CTCCGAAAAT AAATAAATGA GGAGGCCACT GGCCTCGGGT 420
CAGAGGTTTA TCACTCTTCT GCTATGCGAG TGGAATTTGT GACTCTCTGC CTTGTCTCAA 480
CTTGCAGCTC ACATATTTAC CTAAAGTAGT CGTGACCTTT TCACCTTCGG TTCCAGTCAT 540
GTGACAAACA GGGATTTTAT ACTGTAGGCT ATCAACGTTT GTCAATGTGT ATCCAAGTTT 600
ATCTTGCTTA AAATATAATT AAAATCACAA AAATATATAC TTGTTCTTTT TGCATCTAGA 660
TTTAGATAAA TAATTTAATA ATAATTTCTT ATAAGCCTAA AATATTGTTA ATTTGATAAA 720
TTGGTTCGAC GATGTATGAC GAATAAAACA AAATTTTAAT AATCAATATT GTACAAATTA 780
AATAAAACAT ATTTGTGTTT TATTTCAAAA GTGTCTGTCA TAAATTGGTC AAGAGTTA 838