EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06943 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:3765424-3766804 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr13:3766721-3766734AAATCCACTTAAA+6.39
SCRT1MA0743.1chr13:3765602-3765617CTTCAACAGGTGTTT+6.22
SCRT1MA0743.1chr13:3766344-3766359CTTCAACAGGTGTTT+6.22
Enhancer Sequence
TTATAACATA CATTATAATA CTTCATACTT TGAACTACAT ATTTGTTCTC ATAACTTTTA 60
AGAGTAAGCT AGATTAAACA GCAGAGTAAA ACTGTAGACT TTACATCTGC ACAGTACTGA 120
GCTGCATCAT ACTCTGTGCT TTTTCACACT GTCCTTGATT TTATTTTAAG GCAGATGTCT 180
TCAACAGGTG TTTAAGTGTG ACTACATTGA CTGCTATAAG AGTTAACGAG TTAACAAGTG 240
TTGGAGAGCA GGCGCCACCC CTCCCCCACT GCTCTGCTCT GCTGGGGGAT GGGGGAGGGG 300
CGCTGCTGCT GATCACACAC ACACACAGCA GACTCTACAC CTGTAAGCTG AGCTGGCCTT 360
CATCCGCTCA CAGTCACTGT GTGTATTTAA GACATCATAT ATTCTTACAT ATTTATAAAT 420
ATTAAGCCAC TGATTATCAA GAAGTGGGGA AAAGTAGGAC GCAATATTAA AATAAATTGA 480
TCTACATATT TTTTTCTATG TCCTAAACCA TGATAAAACC TCCCAACTTC TCATTTTTTA 540
TCAAAGCATG TTTTTAACTC TGCAGACATT ATTGCAGCAT CATCAGACAG TCACTAAACT 600
GCTATCAGGA GGATTTAACT AATCACAGTG CCATGTTAGA CATCACATTT TCACATGACC 660
AATAATTCGT CAACCACTGT AAAATATCAA TGAAATATTT AAAAATCTAC ATCTGAATGA 720
GCTGAGGGAA ATCTGCATTT AGTCATTTTA GCTATCCAAT GCACTGAATC TATGAGCAGT 780
TATAATAATT AGGACACATG TTTGTTGTCA TCACTTTGTA AAGCAGATTA AGACTGTTTG 840
CTTTAGGTTT GCACAGTACT GAGCTGCATC ATACTTTACA CTTTCCCACA CTGTCCTTGA 900
TTTTATTTCA AGGCAGATGT CTTCAACAGG TGTTTAAGTG TGACTACATT GACTGCTATA 960
AGAGTTAACG AGTTAACAAG TGTTGGAGAG CAGGCGCCAC CCCTCCCCCA CTGCTCTGCT 1020
CTGCTCTGCT CTGCTCTGCT GGGGGATGGG GGAGGGGCAC TGCTGCTGAT CACACACACA 1080
CACAGCAGAC TCTACACCTG TAAGCTGAGC TGGCCTTCAT CAGCTCACAG TCACTGTGTG 1140
TATTTAAAAC ATCATATATT CTTACATATT TATAAATATT AAAACACTTT CCCACACAGC 1200
CCTGGCTTTA TCTAATGGGC ATTGTCTTAA ACAGTTCTTG ATATCTTGTG GCTGTTTAAA 1260
AGATTACTAA ACTTCTCTTA CTTTACATGA ATCTGACAAA TCCACTTAAA ATCATTATGA 1320
CCACATCACA GAACATTTCT CTGCTGGTAT AATGCATCAT ACTCTTAAAG GCTTTGACCA 1380