EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06916 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr13:3035611-3036453 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr13:3036419-3036436GGAATTAATTAATTCCT+7.01
Alx1MA0854.1chr13:3036418-3036435AGGAATTAATTAATTCC-7.01
Lhx3MA0135.1chr13:3036420-3036433GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr13:3036421-3036434AATTAATTAATTC-6.29
MTF1MA0863.1chr13:3036070-3036084TTTACACACGGCGC+6.2
NFAT5MA0606.1chr13:3035800-3035810ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr13:3035800-3035810ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr13:3035800-3035810ATTTTCCATT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:3036422-3036432ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:3036422-3036432ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATTAAGTTA ACTAATTAGT TTTTAGAAAT CTAAGTGAAT TGAACCCAAA ACAATTAAGT 60
TGTCACCCCA AAAAAATTCA AGAATTGTGC TGTTTCATAA TAATAAGTGG TTTAAGCAAA 120
CAGCAAATGT CGTTTCTTGA GTTCAGTAAA GCAATGCATG TGACCCAAAC ATGCAAATAC 180
CATCCTACAA TTTTCCATTA AAATAAATGA ATAAATAAAT AAACTTAAAG CCCAATGAAA 240
GCAAGCCAGA CACATCAGGC TTCAGTTCAG TGGGTTTAAA ACTCGCTAAA ATAAATCTGT 300
ATCTGATACT GCAATCTGGA TAATCCGAAC ATCTGGCAAC AACATGCAGT ACAGATGAGA 360
CTAAGTCAAT ATACTGTCAT CCTGCTCTCC CCCCCCTTCA TCTCCACCAT GGCCACAGTT 420
AAGCCATGTT AAGCACACAG TGATGGTCCT GCTCTGGGCT TTACACACGG CGCAGCTCAG 480
TTTACCCTGT CTGTAAGTGG ACGTGATGAA GTCTCCTGCT GTGGCGTATT GACGGCGCCA 540
CAGACTGCAG GATGCACACA CACACACACT AACATCAACA CACAAAGACA GATTATCAGA 600
ATCCACACAT GTACCATTAT GTCCACAAAC ACACTCTCGT TTAGGCTCCA TCCTGCCATT 660
ATCCATTCAC AAACAGCCAA AGTTCAACTT GTCTGCTGGG AACACTGCCT TAAACAAGAC 720
TTTAACAGAC ACAATATTAA GCTGGTTAAT GTCCTTACTT TCTGAAGGCC ACTCCATCAA 780
TACTTTTACA GTGGATTTTA CACAGAGAGG AATTAATTAA TTCCTTACAT TTATATAGCG 840
CT 842