EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06641 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:43646934-43647955 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT-6.02
CDX1MA0878.2chr12:43647394-43647405GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr12:43647394-43647405GGTCATAAAAC+6.02
MSCMA0665.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr12:43647496-43647506AACAGCTGTT-6.02
TFECMA0871.2chr12:43647066-43647077GGTCACGTGGT-6.14
USF1MA0093.2chr12:43647066-43647077GGTCACGTGGT-6.32
ZNF384MA1125.1chr12:43647433-43647445AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:43647434-43647446AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:43647435-43647447AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:43647432-43647444TAAAAAAAAAAA+6.37
ZSCAN4MA1155.1chr12:43647040-43647055ATGACAGTGTGTGCG-6.35
Enhancer Sequence
GACCAGATTA ATTATCACGT TTAATAATTA CAGTGAAACG CGATCCAGCG GTACATCCTT 60
GATAATATGT CTGACGTGCA CTGCTCACTG GAGCTCAGAC GAGCGCATGA CAGTGTGTGC 120
GTGTGTGTCT GCGGTCACGT GGTGTGCGTT TTCAGTGGAC GGAGGGCTGT TCAGAAATGC 180
TTGGTAAAAC ACTGTGTGGA TGTGGATCAC TTTTGTTCTA AAATGCCATT GTAATACTAA 240
GACGTATTCG TTTAAACAGG CTGTGAGTGT GTATTTTTCG CGAGCAGGTT TGCAACGGGG 300
GCGGAGAATC AGGTATTCTG GCTCAGCATC GTGTTGTCTA TTGGCCACCG GCGATGGACA 360
ATGGTATCGT CTATCAGCCC AACCCTATTA CAATGGGTTT GCTCACCTTT AGTGAAGTCA 420
ACTTGTTACT TTTAAGGCAA TGGGTTTACA CACTTTAAAG GGTCATAAAA CCCCCCTCTT 480
TTTGGTTCAA GTCTAAGGTA AAAAAAAAAA AAAGTCTCGG GATGGGCGTT AGCCAGCAAA 540
GCATGGGAAA AAGAAGGGAT TGAACAGCTG TTAGTTGGCT CACAAAATGA GACCCAAACC 600
GTGAGGAGAC CCAGGATTTT GTCGTTTACA AAAGTTAAAA TGAACAAAAT TAAGAAATAA 660
CTGTAATTTA TTGCCCTGCT ACATTTGTTA TTCGTAATTT CATTATAAAG AATATCATGT 720
AAACACTATA AATAAGGAGG AATTCCTCTT CAATCCCCGG GTGTGAATGC AGACACATTG 780
GAGCAGTGCA GCAGGTCTCT TGCCCTGTCT ATTCCAACTA TTAGCCCTGC CGTTAATCTG 840
GAGGGTTTTA AAAATATGAC AGTATAAATG AAGCAGTGAT TTTATGATTA TGATTTCAGC 900
TCCCTGAAAA AAAAAATCTT AATTAAAAAT GTCTACAACG AGCATGAATG TGTTTCTGAT 960
TAAACTTCAG AAGCAAAATT GTGTTATTTA TGCTGCATTT ACACTGCAGA TCTTGATGGT 1020
C 1021