EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06586 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:42272384-42273736 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr12:42273041-42273055TATATCAATATTAG-7.64
NR2C2MA0504.1chr12:42273219-42273234TGAACTCTGACCCGC-6.17
RUNX1MA0002.2chr12:42272716-42272727AAACCACAGAA-6.32
Tcf12MA0521.1chr12:42272561-42272572CAGCAGCTGTT-6.32
Enhancer Sequence
GTATACTTCA GCCCAGGACT CTCAGAGATT TCTGGCCCTT CATACAAAAA TGTTTGGGCA 60
CCACTGAGAT GTGCGAGTAA TGTGGTCGCA TGGCAATTTC GAGGAATCCA CATCATCTGA 120
TGTTTTGTGC TGCGCTTAAA AATGCATAAA ATGCTGCTTT TAGGAACTAA ATAATTCCAG 180
CAGCTGTTTT TCATCTCCAT CTTTTGAGGA ACATCATTAA AGAGGCTGTT TGTTTGCATC 240
CTCTGTGTGA TTAAAGGTTC AGTTACGCAC GTGGGCGGCG TCGAGCATCT TCAGAATGAA 300
ACTGTGCGAA TCTGTTCAGA GATATACAGT ACAAACCACA GAAGACACAC ACTGAGAGAG 360
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 420
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAC ACACACACAG CTGTGGGACT GTTTCAAGAC AAAGCCATTC 480
GTTCACCATC CTGCGTGCTT AAAATCCTGC ATTAAATCAT TTGTGAAATT AAAAGTGGTC 540
CTTTTGGGTG TGAAATTGTT TTTCAAAGCA AGAGCAGTCC ATTAAAACGA TTTCCTGATG 600
TATAACTCAC ATCAAAAAAG CAACGGAAGA CAAAAGAGAT TTAACTAGCA AGCTTTATAT 660
ATCAATATTA GGGTTACTCA ATTAAAAATT GATGGGCTAA TAATGCACCT GGATCCGATG 720
TGACCTGCCA TTATGTGGAT GTAAGACACG TCTCTAAGTG AGTGTGCGCC TCCACTCTTA 780
CGCCGGTGCC GCTGGGAATC GAAACTGCAA CGTAACACAG CAATAAGGGG CTGAGTGAAC 840
TCTGACCCGC TGACCCTCCC TATTAGAGAC GGCAGCTGGG GAATTTCATT TTGATACAGC 900
AAGGCAGTCA CTAACAGTCC CGCTCCGTGC TACGAGTTGT CATTTCTCAC ATTTTCAATT 960
TCTTTCCTCC GTAGTTTTCA TTTCATAGCG TTGACCTTTT TGACTCTGTC ATGTGGAGTG 1020
TTTGGGTGAT GTGCTCTCAG GAAATAGCTG GAAGTTCCCA ATGATAAATT GTGGACTACG 1080
TTTACTAGTT TGTGTTGCAT CACAATAGCG TTGCGGCTGA GCGACGATTT GTTTTGTTTG 1140
GCAGATTATC CTGGAAGTAC CATTTTGATG TTTCCATTTT GCTTTAACCA TAAACACACA 1200
TAGTTTTGTG ATGCTGTGTG CTTTCTGACA GCATTAGGAT TGTTCTGGGT AAACCACACT 1260
GCATTTAAAT GTCATTTGTA TAAGTGTGGC TTTGGATTCT AAACTATTCA GGGAAGTGGG 1320
CAATTCTAGT GTACTCGCAA TTTGTCAGCT AA 1352