EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06434 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:35848564-35849898 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr12:35849154-35849171GTCTGTTAATTAGTGTA+6.3
IRF1MA0050.2chr12:35848782-35848803TAACAGAAAAAGAAAGCAAAA-6.73
LHX2MA0700.1chr12:35849158-35849168GTTAATTAGT-6.02
Enhancer Sequence
AGCTATAACG TTAAAGTTAT ATACGAAAAG TTATATAAGA CGAAAAGTTG TAGACACACG 60
ATAAAGAAAG CATGCTTAAT TTGATTTACA GAGTTTAACT GCTTCACTTA ACGTTGCTTG 120
TAATTAAAAC TGGGAATTAA CAGTAAACAT TATGTACAGT ATTGTTCTGG CATATGTTCT 180
CTTCTGAGTA GCCAACCAAT AAAAAGAAGG AAACATTCTA ACAGAAAAAG AAAGCAAAAA 240
TGATTCGTTT GTCACCATGA TCAACTCTGA ATAAATCTTT TTAGCAGGGA TTCAAAAGAT 300
TCACGTGATT GTGGTGAATC AATACATCCA TTAACCACAG TAATACACTG ATGCGTTTTT 360
TTGCATTGTA AAATTATAAT TAACAAGATT ATTTTTAATA TTTATTCACT CACACACCCC 420
TTGCCTTGAT CCACAGCCGC CGACAAATCT CTCTCCGCAG AAACTATGGA AACCAACCAC 480
AAAGTTTCAC TGAAACTGCC ACAACTTCAG AGCGTTTACT ACATGGAAGC ATTTTTTTGC 540
CGAATGATAG TCTTTTTATA ATACACTTCT TTGTAGATAA CATTGTAAAC GTCTGTTAAT 600
TAGTGTATTT GAAAGGTGTG GTATGTGATT TTGTGAACTG AAGTGCTTTT GTTGATGTCG 660
CTCGGCAACA AGCGTCGTAA GTTTGTGTGA AGTGTTTCTA GGAGGGCGTA AACTGACGTC 720
TGAAGACACT TGAATCGAAC AATTTGCATT ATTTATAATC CCTAACCCAT ACACCGTTTT 780
AAAAACCACG TATTTGTGTG GGTTTTTAGA TCATTAAGAT GACTGGGGTA AAATGTTTAA 840
GGGGTGAAGC TGGAGATTCA GTACTCGAAT GGTCTTGTAG AGGAGAGGAT GGAGATTTTA 900
ACATTTGTGG ACGCTGTCAG ACTTGTATCC TTTCTGAACA ACTACACCAC ATCGCTGAGT 960
GGATAAACAA GGCTGGATGG GATTCTCGGA AGAGGTTTAT TACTGGTATC CTGGTGCGGT 1020
GCCAAAGTCT TCAAATCCTA GAGAGTCTTC AAAGTGTTTT GCAAGTGACT TCAGGGAAAG 1080
ATTATACTTA TGCCAGGTCC AGAGCCCTGC CAGAGGACAC CATGTGGAGC ATGGATGGAG 1140
GAGGTCCGGA TGGAAAAATA CATGGACTTG ATGTACTGGA GACGTGGGAA TGGTTCAGGA 1200
AGAGCCCAGA TTGGACCAAG TCTAAGTATG TGCTGGGGCT CTTGACATTA TGTGACACCC 1260
ATCTTTTGCA CATGCTAGGG AATCTTGTGC GTGTCCTGAT CATTTGGGAG AAACACAGAT 1320
TTTTGCAATT CAGT 1334