EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06386 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:34617644-34619520 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:34618325-34618338TAATTAATTAATA+6.25
NKX2-3MA0672.1chr12:34619035-34619045TTCAAGTGGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr12:34619319-34619332AAAAGCACTTAAA+6.03
POU6F1MA0628.1chr12:34618327-34618337ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:34618327-34618337ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CACACACACA CACACACACA CACACATCTC CTTCTCTCCC CACGCGCGCA CTTACACACA 60
TTCTTTCTTT TTTTTTCTTT CACTCACGCA CACACAAACA GACACACTGT CCATGTGCCA 120
GCGCGAGCTG CCCTACTGTG GGACGCGGGG ATAATTAATG CGGAGTGACT GATTGCTCTC 180
GAAACAGACC AGTCCCGCGA ACGGCATTGT CCGTGATCAA TGAAGCGTTT CTGATTGACA 240
CTTTCCCTCC ATCTTCCAGC CACATTCAAA CTACCGGAAC GGGGCGTTTG TCACCAGCGT 300
ATAGGCCAAG GGGTGTGCAG ATACCCAGTT ATTGTCAGGC CTATAGTTGC ACACCAGTTT 360
TAGTTAGTGC GGGATCCCAT CGCCTGCCTT TGGCCAAAAA TAACTCAAAA GGTACTCCTA 420
AATTCAGAAC CCACTCTGGT GCGAATAAAC GGTGCTTACA TGCGCCTACA CGTCCATGTA 480
GGTTAGGGGA TTTTATGTAC GCGTCCGTTG GATGAATCAC TGTGACAATG TACTCCATAG 540
CTGGTGTCGA GGATGGAGCA TGTTCAGTCA AGACGTTCAT TCGCTCACAG CCCTGTAAAA 600
CGCCCAGAGA TGTCCACCAG GGAAACGGCA CGAGAGACAT GATTTTAAAA CATCCACTGC 660
AGGCATATGC ACCGAACAAC ATAATTAATT AATACTGTGT AATTTAACAT GAAGGTGAAC 720
ACGAAGTGTA AAATTGCAAG TTAATATTGA ACAAAACAAT AAGATCAACA TTTGTTTTGC 780
TTAACTGAAT TTCATAGAAA AATCAAGAAA TCAAAAACTA TTTTCAAATG AGTCCACACC 840
GGCGTCTGAA TCCAGATGAA GCTGAATTGT ATGGTGACCT CTCCTCTCCT TTTGATGATT 900
AAGCTAGATT TCAGCATGCG CTGACTTATA CATGGAGCTA CAGTTTTAAA TATTTTGCAA 960
CATCAGAATT GCTAAATTCT TGTGAAATGA CTTGGCCTCT GGTGTGTCAG GCAACAGGGA 1020
CATGCACACA CAGCTTGGAC AAACGGTTTT TAGACAGTCC AATGTGTGCC GTACTACCAC 1080
ACACATCCGA AAAGGGAACT TGTATCTAAA GCTATGAAAT CATAATTAAG ATTTTAAATG 1140
CACAAAACAT TAAATGATTG TGTATTTAGC TCCGTTGTCC CCGATTGAAA CGTTAATACT 1200
GTCGATGACC AGAAGTTTAC AAGGAAGAAC CATGCGATTA GAAACTTGCT GCATATTTGA 1260
TTTTAGTAAT CCAACACGAT TGGGTAATGA TAAGACAGAG TTAACATAAT TAAATCTCTA 1320
CATAACAATA CATCAATGAG AATGTAGACT CTGACCCTAA CCCTAAAACC GAAGTAGGCC 1380
TATACTTTGG GTTCAAGTGG TACAGGCCCA GGGATAAATT GTGATTGACA AAATAATACT 1440
GATAATAAAA CTAATAATAC TCATAATACA ACAAAATCTA AAATAAGACT GGATACCGAC 1500
TTTGTCCTTT TATAAATTCC AGGGAATGGC GTTATCGATA GAAAAAGCCC ATCTGTGTCC 1560
AATTAAGGGA AGTACTGCTT CACCCCCATA AATGGCACAA ACCTACCTCA TTACGACCTG 1620
TTTTATTGTA AAAGCTAGAA GTCAAACCAT AGAGGTAAAT AAATGCAACA AAATAAAAAG 1680
CACTTAAAGA AAGTTGTTTT GATGTTAAAA GAATAAACTC AAGAAACTTT ACGCTATTAC 1740
TCTACCTTCT TATAGGTCTT TAGAAAAACA GAAGTACAAA AACACAAGTA AATGTATGCC 1800
GTTGATATGC ACCAGTTTTT AACTGACCCA TTTACTGACA ACCCCACCCC CCATAGTGCT 1860
TCATTAATGA GATTGT 1876