EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06147 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:28821554-28823016 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JUN(var.2)MA0489.1chr12:28821986-28822000AGGAAATGACTCAT+8.12
KLF9MA1107.1chr12:28822019-28822032CGTGGGTGTGGGC-6.16
SOX10MA0442.2chr12:28821581-28821592AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr12:28821581-28821591AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
CAAATTCAGC AAGAAAAATA TGAAAAAAAA ACAAAGGAGA TTTCTAGAAA GCTGATTATA 60
AATAAAACAT TTTGCATTCA GTACAAAAAG TTAAGAATGC ATTCAAGAGA CAACAACAAA 120
TTAGGATTTT CATAATAAAA CAATAACATG TCTGAGGACA AAAGTGTGAC AAATTTGTAA 180
ACTTAAAAAC ATAGGAACTT ACAAACACAA ACAAAAAAAC AAACAAATGG GGAGCTGTTT 240
CTTCAACATG TCCACAAAAA GATAGAACAC AAACAAGCCA AACTTAACGC CATTAAAACA 300
AACAACTTAA GTTCTCTGTT TTAAAAGTAG TCGGCTTTCT ACTTTAATTT TAAGTCACGT 360
TAAACGCCAT CTACAAAGAC AGCCCACAAG CTTTTGAGAC ACAGCCACAC ACAGAATCTC 420
AGTACAGTAC ATAGGAAATG ACTCATAGAG GAGTTGAACC CAACGCGTGG GTGTGGGCGC 480
TATTAAAACA AGACTGAAAG TTTGGGGTGG GTCATTCACA CGCGCTGCTT TTGCTATGCT 540
AGAAACCCAG TTGTGGATTT TAATCTCTTG AAATCGCTGC GGGGATTTCA GTCCATAGAA 600
AACTCAATGG ATTCCAGTGC TACGTTGCGG TGTCTCTACT GGATTTCACT AGTGTTCGCC 660
ACGCTTATAA ATGGAATAAA CGCAGATAAA AGTAAGGATA TTCACATTTA CTTGCTTAAT 720
ATCTTTATTG TATAACTTAA CATACGTGTG AGGTTTGTTT TTCCGTTGAT ATGTGAAAGC 780
TCCAACCTCT GTGTGTCATT TGTCCTCTTG CTAAGAACAT GGACTTGAAG TCAGTGGAGT 840
TAATGACGAT GAACTGCCTC ATTCGTAATA GCTTCCTTTA CTAGTTACAG TTCCCACCGG 900
TTCCGCATTC CAATGCTCTT ATTTCACTCC CGCCCGCTCC ATGGGTCGTA TTGTGCCCAG 960
CTGAGATCAG TGCAACACAA GAAGCTTCAG CTTTCCAGCA GGAACATGAG GCTTGCACTG 1020
CCTTTGTTAC TCTGGAATGT GTATGTTACT CCTGGAACGG GTTTAAATGT AAAAACACAA 1080
AAAGAAGTCT GCTGTGGAAA AGGCATTAGG CATTGTCTTG GGTTAAGGTG CCCACATTAA 1140
TGTCCTTGTT GTAGTTAATG CCTTTATTTA AGATGTGTAA GGTTAAGAGG TGTTACATTA 1200
CAGCAAGACA ATATTATTCA TAGTCTTATA GATGTAACTG TGCACTTCAA AACATGCTTA 1260
GATCATCACA GTTCTCTAAC AGAGGGGCCG AGACCCACTG GGGCCTCAAA AGCTGCCAAG 1320
GTGGCCTCAG GAAATTTTCA TAAAACAACA TGAAAAAATG TAATAAATAA AATATGAACA 1380
GTTTTACATC CAGCCGAGTT CTTCTGGTGC ATATTACCTC AGTATTTATA GCTGACAAGT 1440
GCTTCATATT ATATTATTTT CA 1462