EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06112 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:27496472-27497704 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:27496620-27496632AAATAAACAATC-6.62
Nkx3-2MA0122.3chr12:27497643-27497656TTAACCACTTAAG+6.5
Enhancer Sequence
TGTGCGTGCG TGCGTGTGTT CAACAGTACA AACTCACGAA CATTTGACAC AAGTAAAGAG 60
TGAGAAAATG ATGACAGGAT TTTTGTTTTT GGCTGAATTA TCTCTTCAAG ACCTTACAGA 120
ACTCCAAAAG CAACACTGTT GTATTTTAAA ATAAACAATC TGCAAAGTAG CTCTGAAAAT 180
AATAAACAAG CCCACATCAC TGCCCATAAC ACGCTTTAAG TTATAATATA ATACAGAATT 240
AGACTGTAAA GTAACAACGT GTAACGACGT ACAATCCTTG ACTGTACTTG TGGAATGAGG 300
CTAACCAGCT AACGTTAGTT ACCAACGTGA CACGGTCACG GTAGATTCAT AAACTTACCA 360
AGGTCCTTAT CATTTATTCC CAAATGGTTG TCAAGTTCAG TACAAACTTT AGACACCAGA 420
GACAAATATT CGAGCTTTTT GAGCTCGTCT TCTCCGATCT CTGCCATCTT CAGCAATGTT 480
GTTGTTTTTC ACCGGAAGAA AATGGCACTG CTATCGCTCG TCCGGTAACT TCTTATTCCG 540
GGTTACATTA CAATCGCCCT CTAACGGTCA AAGGAAATAT TGCTAAATGA TTTGTGTGTA 600
CATCTTTCAT AATAAAATTA TTTGTTGAAA AATACGGTAA CACGCCAGGA TTTGTTTATG 660
AGCACGAATT AACTACGTTA GCTAACATGC ACAAGCACTG AACAACACAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA ATTAACCAGG 780
GATTTGCAGC ACTAACCTAC TAACCATAGT TTGGCATCTG TAGTGAAATT AATTCGCTAA 840
AACAGTTGCA CTTTTAATCT TTCTAAGAGA GTTAGTTTAT GATCTAATTA ATGTTAACAA 900
AGGAACCGTT AATTTTCCTT CGGCTTAATC CCTTCATCAG GGGTCACTAC AGCGGGATGA 960
ACCACCAACT TATCCAGCAC GTGTTTTACA CAATGGATGC CCTTCCAGCT GCAACCCAGT 1020
ACAGGGAAAG ATACACATTC ATTTAGACAC ATATACTACG GTCAATTTAG TTTATTCAAA 1080
TCTTTTTATT GTTTACAGGC ATATTTGGAT TGTGGGGGAA ACCAGAGCAC CCAGAGTAAA 1140
TTGATCTAAA AGCCAATAAG CCATACATAT TTTAACCACT TAAGAGTAAA TAGTGAGAAA 1200
TTTGAGGGGG GAAAAGGGTT ACACACAAAT CC 1232