EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:27032019-27033949 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr12:27032239-27032250GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr12:27032239-27032250GTTTTATTGCC-6.62
E2F7MA0758.1chr12:27033513-27033527ATTTGGCGGGAGAT-6.15
E2F8MA0865.1chr12:27033514-27033526TTTGGCGGGAGA-6.32
FOXB1MA0845.1chr12:27033577-27033588ATATTTACATT-6.32
HOXA10MA0899.1chr12:27033937-27033948TTTTTATTACT-6.14
HOXD9MA0913.2chr12:27032239-27032249GTTTTATTGC-6.02
Lhx3MA0135.1chr12:27032102-27032115AGTTAATTAATTC-6.15
USF2MA0526.2chr12:27032822-27032838GGAGGTCACGTGAGCA+6.32
YY1MA0095.2chr12:27032705-27032717AAAGATGGCGGC+6.22
YY1MA0095.2chr12:27033556-27033568CAAGATGGCCGC+6.62
Enhancer Sequence
TACATGCTTG CTGAGTATCT CAATAAATGT AAAGAAATAC AATGCATATA CATTGTCACT 60
AAATGTGTTA AAATTTTATA AAAAGTTAAT TAATTCAGAA TATTACCTCT TGTGATGCTT 120
TTGGAGTCTT TTTGGACAGC ATGCACTGCT GAGCTTCAAG AGCATTGCCT TTTCGAGGGT 180
ATAACCCACA GACCATGCTC GGTCACTTTT GGGTTATACT GTTTTATTGC CCCAATAAAT 240
GTCGGAAATA AGTGTTTGTT CGTATATACA GGAAGCAATT CTTTCCTCCA CGCATGTTTA 300
GTGCTGTAAA AAGCTTTCAC GTTCCATTTG TCTATTTTTC TCTTAAAGTC ACATGACAAA 360
AGAACGCAGA CTATTGAGAA ACACGCAATT GTGCGGTTTT ATTTTAGGGT AATTGGTCTA 420
TTTCTGGTTA AATATAAACT GGTCAAAAGT ATAGTATCTC TGTATATAGG CTAGTTAGCA 480
TTTTAGATAA AGGCCTACAC ATTTTAATTG TTTAGAAAGA ACCAGTGCAA AACATTTGTA 540
GTGATTGACT ATGGACTATC TCTAAATCTG ATATCAAAAA TTATAACCTT GGTTTTACAT 600
TTTTAAAAAG AAATAATGCT ATCACAAGCT ATAGCTGTCT TTGGATGTTA ACGAAGTGAT 660
GTGCTTTTCC TCCTCTTTTA ACGAATAAAG ATGGCGGCGA CCGAGTTACT GGTGAAGCAA 720
AGCAATAAAC TCACAGCTGT TTATGAAAAT TTACAACTTT GTGATAGAAC TTTATGTGTG 780
GTTCTGCCAG TGGATTGGCT GACGGAGGTC ACGTGAGCAG CTCTCTGTGA ACATGAACTT 840
TTTATGATTT CCCAAGTGGC TATAATGCAG CATTCTTTTG GTCAGGGCGC AGTCAGTAGC 900
ACCTCTGTCC TTTATGTTTT TTACGTTTTG TTAAAGCAGA GAAAAAGGAA AATCTCTTGA 960
GCTTGCCGAA TAGTGTGCGT TAATATGGAT GGAAAGCTCG ACGTCACGCT AGGACGAAAC 1020
GTCTTCAGAT TTTCACATCA GTTAGGAGTG CAAGGGTCAA AATTCACTGA GGACCTTAGT 1080
CCATTCTTCT CTAATTTATC AAGTTTTAGC TCTTCCTGCA TCTCACGTGC ATCTAATAAT 1140
ACGACACGAG ATCCTGGTTA ATCGGCGAAC CTGCTTGATT GTTTTGGATC ATTCCAGTGA 1200
AGCAATGATG ACGGGGAAAA AAGGTAGGAC TAGACCTATA GTCTTCTGTA TTGCACTGCA 1260
CCGATGTCAT GATGCAACCC AATGTGGGCA TATTTCATTT AAAACACTAC CACTAACATG 1320
TATTTTGCAT AACAACACAA GCTGATTAAA GTTAGATCAT TTGGATCATT TAAATTGATA 1380
ATAACTCTTA TAAACATTTA ACAAACCTTC AAGAGTCGTA TGCTAGTTAT AAAGATCAAC 1440
ACAGCGAAAC GCAATCAGGC CTTTTGTGTC AGTGTTTTTA AATGCTGACG GCTTATTTGG 1500
CGGGAGATAT TAGAAATAAC CTTTATTTAC AGAGTTACAA GATGGCCGCT GTGTACTGAT 1560
ATTTACATTA ACACTGAGTT TACAAATCTC TATATTGAGT TTCTGAATAG CAATGCGATG 1620
CCACAGCTCT GTCATTTTGC GATAATGTTT TTGTTATGGA CTGTTTAAAG TGGATGCTGT 1680
TTCTGCTGTT GGTTTAAAAG TGTTTCTCGG AATTTGTTAA AAATTACAAA ATTTTCCTTC 1740
AAAGGGATGG GTTTTTGCTT TTAAAAGGAC ATTTGTAAAG ACAAATATGC CTTAAAAGCA 1800
TAATCAACTA TCTAATGGTT ACTGAATTTG TTTTTGAGAA CAAAATGCAG TAGTTTGAAA 1860
CGGATTTTTT GCCAAAAAAA AATTATTCTT AATCTGAATA ACCAAGATTA GGCTATGTTT 1920
TTTATTACTA 1930